297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1155 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
235 aa  476  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3054  MgtC/SapB transporter  72.22 
 
 
239 aa  337  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  49.36 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  44.35 
 
 
244 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  37.69 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1965  putative MgtC family protein  36.59 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  34.67 
 
 
232 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1323  MgtC/SapB transporter  40.34 
 
 
228 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  34.42 
 
 
233 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  48.74 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  37.37 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  36.7 
 
 
245 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  33.95 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  49.58 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  51.52 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  37.97 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  36.41 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  41.03 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  36.41 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  36.41 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  41.03 
 
 
225 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 
225 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  41.03 
 
 
225 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  46.27 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  41.03 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  44.93 
 
 
228 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  40.38 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  41.03 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  41.03 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  41.03 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  41.03 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  36.14 
 
 
229 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  40 
 
 
240 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  40.74 
 
 
240 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  41.48 
 
 
232 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  39.74 
 
 
225 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  48.46 
 
 
133 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  33.51 
 
 
228 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  35.03 
 
 
227 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  40.6 
 
 
165 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  33.48 
 
 
221 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  48.46 
 
 
133 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  37.58 
 
 
233 aa  102  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  44.2 
 
 
216 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  35.32 
 
 
231 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  41.18 
 
 
215 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  41.54 
 
 
223 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  46.92 
 
 
133 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8016  MgtC/SapB transporter  46.72 
 
 
225 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  33.5 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  45.24 
 
 
231 aa  99.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  33.5 
 
 
215 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  38.35 
 
 
170 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  33.5 
 
 
215 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2512  MgtC/SapB transporter  33.86 
 
 
231 aa  99  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  33.5 
 
 
215 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  33.5 
 
 
215 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0407  MgtC family membrane protein  46.4 
 
 
301 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  33.5 
 
 
219 aa  99  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  43.94 
 
 
219 aa  99  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  35.29 
 
 
185 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  33.5 
 
 
219 aa  99  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  40.77 
 
 
225 aa  99  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1969  MgtC family membrane protein  46.4 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1877  putative magnesium transporter  46.4 
 
 
305 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  41.73 
 
 
189 aa  98.6  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0141  MgtC/SapB transporter  41.29 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  33.67 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  43.94 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  36.64 
 
 
168 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1376  MgtC/SapB transporter  46.36 
 
 
218 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  36.99 
 
 
170 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  43.7 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  38.41 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  43.18 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  47.83 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  41.78 
 
 
172 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  30.89 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  40.27 
 
 
164 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  41.67 
 
 
150 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  43.94 
 
 
163 aa  95.5  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  49.11 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0058  MgtC/SapB transporter  38.41 
 
 
173 aa  95.1  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  41.1 
 
 
172 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  41.1 
 
 
184 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5362  MgtC/SapB transporter  36.45 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0134811  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4773  MgtC/SapB transporter  36.45 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.347441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5498  MgtC/SapB transporter  36.45 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178344  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5378  MgtC/SapB transporter  51.35 
 
 
232 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  42.86 
 
 
172 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  44.96 
 
 
174 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4832  MgtC/SapB transporter  51.35 
 
 
232 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3295  MgtC/SapB transporter  37.09 
 
 
231 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0387472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  40 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  37.59 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07790  MgtC/SapB transporter  36.41 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  45.11 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  47.32 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  39.23 
 
 
167 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1926  MgtC/SapB transporter  44.44 
 
 
216 aa  92.4  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>