More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3167 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3167  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  68.35 
 
 		 329 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3462  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.72 
 
 		 329 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.09 
 
 		 329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0525  putative lipase  65.16 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0941  putative lipase  57.5 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3541  hypothetical protein  43.51 
 
 		 310 aa  271  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.97 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  34.38 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  35.21 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  37.31 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.57 
 
 		 311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.21 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.06 
 
 		 311 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.49 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  35.61 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.48 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.98 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.4 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.6 
 
 		 328 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.06 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.08 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.82 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.58 
 
 		 376 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.86 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  34.87 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.87 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.7 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.73 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.36 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  35.15 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  31.92 
 
 		 323 aa  148  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.92 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.29 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.66 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.68 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  34.44 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.95 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.55 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  34.17 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.06 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.78 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.63 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.19 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  38.14 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.38 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.33 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.53 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.24 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.24 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.98 
 
 		 329 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  31.77 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  31.09 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.86 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.66 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  29.59 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.11 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  33.84 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.97 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.74 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  34.51 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  34.51 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  34.51 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  34.51 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  34.51 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  34.51 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  33.45 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.01 
 
 		 325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  34.03 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.16 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.66 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.95 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.25 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.42 
 
 		 628 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.1 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  34.15 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  33.08 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.82 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3651  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.51 
 
 		 373 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.85 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.96 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.6 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.84 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.59 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.05 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.84 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.57 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.56 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  36.55 
 
 		 383 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  34.17 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.05 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.17 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.17 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.46 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.75 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2377  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.75 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.75 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.28 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>