More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2957 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  53.92 
 
 		 713 aa  744    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.99 
 
 		 705 aa  653    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  72.57 
 
 		 716 aa  1074    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  76.1 
 
 		 722 aa  1160    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  70.81 
 
 		 738 aa  1079    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  61.54 
 
 		 720 aa  880    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  70.15 
 
 		 717 aa  1070    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  63.46 
 
 		 722 aa  942    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  66.86 
 
 		 716 aa  1013    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  50.84 
 
 		 704 aa  733    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.41 
 
 		 712 aa  730    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  76.8 
 
 		 722 aa  1169    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  62.76 
 
 		 717 aa  931    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  56.58 
 
 		 713 aa  861    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  58.16 
 
 		 746 aa  806    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 		 717 aa  1468    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  34.86 
 
 		 714 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  35.28 
 
 		 714 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  40.61 
 
 		 510 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.07 
 
 		 473 aa  362  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.61 
 
 		 475 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.61 
 
 		 475 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  39.63 
 
 		 505 aa  350  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.13 
 
 		 472 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  39.55 
 
 		 507 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  41.34 
 
 		 515 aa  343  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  40.04 
 
 		 510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  38.9 
 
 		 516 aa  336  7.999999999999999e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  40.2 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  38.21 
 
 		 507 aa  325  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.84 
 
 		 494 aa  324  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  40.69 
 
 		 486 aa  323  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  37.65 
 
 		 508 aa  323  9.000000000000001e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.78 
 
 		 473 aa  319  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.54 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.36 
 
 		 495 aa  316  9e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.52 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  38.79 
 
 		 525 aa  314  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  39.67 
 
 		 509 aa  314  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  36.51 
 
 		 507 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.66 
 
 		 472 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.93 
 
 		 480 aa  302  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.07 
 
 		 482 aa  300  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.1 
 
 		 515 aa  300  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.39 
 
 		 482 aa  300  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.01 
 
 		 488 aa  300  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.56 
 
 		 474 aa  297  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.5 
 
 		 475 aa  292  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.17 
 
 		 484 aa  280  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  38.58 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.62 
 
 		 508 aa  277  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.02 
 
 		 520 aa  277  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  33.68 
 
 		 504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  37.39 
 
 		 546 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  36.77 
 
 		 470 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 		 562 aa  267  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  35.34 
 
 		 546 aa  266  8e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  35.34 
 
 		 546 aa  266  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.88 
 
 		 470 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.13 
 
 		 470 aa  264  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  35.98 
 
 		 532 aa  263  6.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  36.93 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.64 
 
 		 472 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.19 
 
 		 473 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.09 
 
 		 463 aa  257  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  34.12 
 
 		 557 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.54 
 
 		 484 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  32.31 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  34.97 
 
 		 467 aa  249  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  34.75 
 
 		 503 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.68 
 
 		 484 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.32 
 
 		 484 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  33.41 
 
 		 464 aa  247  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  32.83 
 
 		 550 aa  247  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  32.24 
 
 		 499 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 		 458 aa  244  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  32.87 
 
 		 464 aa  243  9e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.49 
 
 		 489 aa  243  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.9 
 
 		 465 aa  243  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.45 
 
 		 473 aa  243  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  32.51 
 
 		 551 aa  242  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.58 
 
 		 465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.88 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  34.14 
 
 		 464 aa  241  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  33.48 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  31.28 
 
 		 550 aa  238  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 		 470 aa  237  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  34.46 
 
 		 477 aa  237  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  53.1 
 
 		 231 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  34.32 
 
 		 552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.68 
 
 		 486 aa  234  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  33.14 
 
 		 767 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 		 481 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  34 
 
 		 459 aa  234  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  34.3 
 
 		 464 aa  234  6e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  32.62 
 
 		 475 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  34.93 
 
 		 546 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.63 
 
 		 468 aa  233  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  33.76 
 
 		 745 aa  233  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 		 473 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>