158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1534 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 238 aa  494  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.4 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  50.45 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.61 
 
 		 213 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.7 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  50.23 
 
 		 218 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.23 
 
 		 218 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.23 
 
 		 218 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  47.96 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.67 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.2 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.2 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  47.93 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  48.85 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.68 
 
 		 241 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.08 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.29 
 
 		 197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  46.83 
 
 		 199 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  46.45 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.59 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.32 
 
 		 197 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.85 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  46.63 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.79 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.06 
 
 		 218 aa  174  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  44.29 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  44.09 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  44.29 
 
 		 216 aa  167  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  44.61 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  40 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  42.99 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  42.99 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  50.9 
 
 		 172 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.18 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.66 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  38.5 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.71 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  38.32 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  37.73 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  39.71 
 
 		 555 aa  148  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  40.87 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  40.87 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  38.81 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.06 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  39.27 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.1 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  37.9 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.34 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  38.5 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.41 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  38.03 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  41.82 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  36.53 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  37.67 
 
 		 333 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.14 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  33.18 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  40.72 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  42.16 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.19 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  25.27 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  26.4 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  23.7 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003652  maleylacetoacetate isomerase/glutathione S-transferase  27.32 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.26 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  31.46 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.87 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  26.01 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  25.26 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.37 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.5 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  26.82 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.23 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  25.63 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  22.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  22.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  22.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  22.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  22.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  22.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  22.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  22.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  22.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  22.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  22.94 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.16 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  22.16 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.16 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.16 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  26.37 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  22.16 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.16 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.16 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  32.79 
 
 		 241 aa  45.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  22.49 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  34.21 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.84 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.84 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>