More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0750 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0750  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  194  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3038  heat shock protein DnaJ-like protein  82.8 
 
 		 94 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.928847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1850  DnaJ domain-containing protein  81.72 
 
 		 94 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1539  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  81.72 
 
 		 94 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1606  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  81.72 
 
 		 94 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00300072  normal  0.339336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1600  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  81.72 
 
 		 94 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.537341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  79.57 
 
 		 94 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0852729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1832  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  79.57 
 
 		 94 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.244123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1868  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  79.57 
 
 		 94 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0272604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2457  heat shock protein DnaJ domain protein  79.57 
 
 		 94 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000320738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1631  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  79.57 
 
 		 94 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.261278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1823  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  76.6 
 
 		 94 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00689544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1339  DnaJ domain-containing protein  38.64 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 		 380 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 376 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  43.28 
 
 		 376 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  43.28 
 
 		 377 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 377 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  43.28 
 
 		 376 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 376 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 376 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 376 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 376 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 376 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 376 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  40 
 
 		 380 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 378 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1350  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 368 aa  64.3  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 375 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 377 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 379 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 379 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 379 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 380 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 379 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  40.3 
 
 		 645 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 372 aa  63.5  0.0000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 379 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 379 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 376 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 378 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 376 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  43.48 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  39.53 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3127  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82415  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 374 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 375 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 374 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 374 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  37.8 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 374 aa  61.6  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  37.8 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3228  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.862412  normal  0.903575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 379 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 375 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 379 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 382 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 379 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 379 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 380 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 379 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 379 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 382 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 		 382 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 382 aa  60.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 376 aa  60.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 381 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89287  predicted protein  41.43 
 
 		 346 aa  60.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0180509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 382 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3252  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 376 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  37.21 
 
 		 380 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0641  heat shock protein DnaJ-like  32.26 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  41.79 
 
 		 381 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 368 aa  60.5  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 368 aa  60.1  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 373 aa  60.5  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.343225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>