298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1509 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1509  HI0933 family protein  100 
 
 
379 aa  772    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000081979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1736  HI0933-like protein  46.34 
 
 
384 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0743  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.88 
 
 
379 aa  335  5e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.276472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  40.86 
 
 
394 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  40.61 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  40.36 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0409  oxidoreductase with FAD/NAD  41.16 
 
 
383 aa  272  6e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  40.1 
 
 
394 aa  272  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  40.81 
 
 
393 aa  272  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  39.85 
 
 
396 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  40.1 
 
 
394 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  39.59 
 
 
394 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  39.34 
 
 
394 aa  269  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  39.34 
 
 
394 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  39.09 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  41.31 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  38.65 
 
 
398 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 
401 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  39.49 
 
 
394 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  41.28 
 
 
398 aa  262  8e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  40.05 
 
 
398 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  40.69 
 
 
405 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  40.05 
 
 
398 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  39.8 
 
 
398 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  39.8 
 
 
398 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  39.8 
 
 
398 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  38.54 
 
 
394 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  39.31 
 
 
405 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  38.11 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  38.42 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  37.97 
 
 
398 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  38.35 
 
 
394 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  38.11 
 
 
460 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  38.11 
 
 
460 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  38.32 
 
 
393 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  39.23 
 
 
397 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  38.01 
 
 
392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  36.96 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  38.89 
 
 
405 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  37.96 
 
 
413 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  38.03 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  38.03 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  38.03 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  38.03 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  38.03 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  38.03 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  38.03 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  39.35 
 
 
400 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  39.35 
 
 
400 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  38.72 
 
 
397 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.35 
 
 
400 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.35 
 
 
400 aa  243  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  39.35 
 
 
400 aa  242  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  37.7 
 
 
394 aa  242  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  39.35 
 
 
400 aa  242  9e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.35 
 
 
400 aa  242  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.35 
 
 
400 aa  242  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  38.85 
 
 
391 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6778  HI0933 family protein  39.02 
 
 
390 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  37.74 
 
 
407 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  38.95 
 
 
407 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2218  putative transmembrane protein  38.44 
 
 
412 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  38.85 
 
 
394 aa  240  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  37.7 
 
 
394 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  38.81 
 
 
400 aa  239  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  38.5 
 
 
414 aa  238  9e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  36.2 
 
 
392 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  37.47 
 
 
393 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  37.24 
 
 
392 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  38.29 
 
 
399 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  37.25 
 
 
401 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  37.53 
 
 
399 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  37.35 
 
 
433 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  37.11 
 
 
402 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  37.73 
 
 
410 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2423  HI0933 family protein  39.21 
 
 
407 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  35.94 
 
 
392 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  36.78 
 
 
428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  36.64 
 
 
393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  35.95 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3018  hypothetical protein  37.53 
 
 
404 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943538  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  35.48 
 
 
393 aa  236  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  38.44 
 
 
394 aa  236  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  35.48 
 
 
399 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0885  hypothetical protein  39.26 
 
 
416 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  37.21 
 
 
393 aa  235  9e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  36.39 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  36.53 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  37.03 
 
 
409 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0592  HI0933 family protein  35.47 
 
 
405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  38.11 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  38.11 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.151985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  38.58 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  36.01 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  37.33 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  38.11 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3645  hypothetical protein  38.11 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  38.36 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0198176 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1308  HI0933 family protein  36.6 
 
 
426 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0313133  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4817  hypothetical protein  37.67 
 
 
406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>