More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1326 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1326  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 433 aa  896    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000214517  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0688  glutamyl-tRNA reductase  56.71 
 
 		 422 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0940243  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  52.73 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0770  glutamyl-tRNA reductase  50.93 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1051  glutamyl-tRNA reductase  52.15 
 
 		 427 aa  450  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00451156  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0859  glutamyl-tRNA reductase  48.38 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0924191  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  52.27 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0567  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.232431  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0646  glutamyl-tRNA reductase  49.3 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1388  glutamyl-tRNA reductase  49.3 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.32 
 
 		 434 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  35.55 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.32 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  35.35 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  34.59 
 
 		 434 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 434 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 		 458 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 458 aa  225  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 420 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.05 
 
 		 438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  34.81 
 
 		 416 aa  216  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  35.2 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 425 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  32.49 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 441 aa  212  9e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  34.12 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 464 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 442 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.7 
 
 		 461 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  31.69 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  34.15 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  32.51 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  35.37 
 
 		 419 aa  202  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  30.24 
 
 		 430 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  31.6 
 
 		 440 aa  199  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  32.95 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  32.16 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  32.02 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  32.4 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  30.54 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  32.24 
 
 		 434 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 432 aa  196  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.93 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  32.69 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  31.92 
 
 		 426 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  34.13 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 		 418 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 		 418 aa  193  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  33.75 
 
 		 418 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 		 418 aa  193  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  31.15 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  29.81 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 		 418 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 		 418 aa  192  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.55 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  34.15 
 
 		 434 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  31.96 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 418 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  31.93 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  31.92 
 
 		 420 aa  189  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  30.66 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  30.8 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  30.65 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  31.64 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  30.14 
 
 		 459 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  32.2 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  32.2 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  32.2 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  30.48 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  32.2 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  32.2 
 
 		 416 aa  186  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  31.93 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>