51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0469 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  100 
 
 		 432 aa  860    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  51.21 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  50.79 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  44.1 
 
 		 458 aa  329  7e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  43.71 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  38.95 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  41.39 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  31.63 
 
 		 384 aa  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  32.37 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  29.75 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  32.35 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  31.64 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  23.26 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  34.86 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  27.63 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  23.14 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  24.1 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  22.98 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  25 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  32.89 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  32.89 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3692  outer membrane porin  24.67 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  23.36 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1463  hypothetical protein  23.51 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  29.12 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  29.12 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  26.88 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  26.88 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  25.05 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  25.68 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  30 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  30.64 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  23.46 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  28.65 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  22.58 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  22.84 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0396  major outer membrane protein  25.74 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  25.14 
 
 		 417 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  31.32 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  25.48 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  26.06 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  23.5 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0114  hypothetical protein  29.63 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  23.9 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  23.58 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2005  outer membrane porin  30.67 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  22.71 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0135  hypothetical protein  26.8 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  28.42 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  22.29 
 
 		 417 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>