26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3233 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  81.06 
 
 		 396 aa  683    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  805    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  83.59 
 
 		 396 aa  670    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  84.34 
 
 		 396 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  43.55 
 
 		 409 aa  256  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  39.95 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  39.6 
 
 		 400 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  38.24 
 
 		 398 aa  232  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  37.11 
 
 		 411 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  38.35 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  39.08 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  36.43 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  33.93 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  35.41 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  35.11 
 
 		 408 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  28.51 
 
 		 482 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  29.04 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  32.09 
 
 		 400 aa  150  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  32.19 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  33.59 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  30.72 
 
 		 448 aa  132  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  31.51 
 
 		 451 aa  123  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  26.87 
 
 		 329 aa  96.3  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  31.32 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  24.01 
 
 		 419 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>