More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0255 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0255  Cold-shock protein DNA-binding protein  100 
 
 		 71 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1504  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  82.61 
 
 		 72 aa  116  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.65 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  58.82 
 
 		 67 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  54.93 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2027  cold shock-like protein CspC  59.15 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  57.97 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0221  cold-shock DNA-binding domain protein  58.82 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1648  cold shock domain-contain protein  57.75 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  56.34 
 
 		 69 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  57.58 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  57.58 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.06 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  56.34 
 
 		 69 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  56.34 
 
 		 69 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  59.09 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  56.34 
 
 		 69 aa  85.5  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  58.21 
 
 		 68 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  53.62 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  56.52 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  56.34 
 
 		 69 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  56.34 
 
 		 69 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  53.52 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  56.52 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  53.52 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2622  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.75 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2689  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.75 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  53.52 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  53.62 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  53.52 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.07 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1465  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.07 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.359616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.52 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  56.72 
 
 		 68 aa  84  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02738  putative Cold shock-like protein  60.61 
 
 		 70 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  59.09 
 
 		 67 aa  84  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  53.52 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  53.52 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  53.52 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0587  cold-shock DNA-binding domain protein  59.42 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  57.97 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  54.93 
 
 		 69 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03406  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0156  cold-shock DNA-binding domain protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  54.93 
 
 		 69 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  54.93 
 
 		 69 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0160  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1920  cold shock-like protein CspC  57.75 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000217103  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3864  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  54.93 
 
 		 69 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  54.93 
 
 		 69 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4052  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.06 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3973  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  54.93 
 
 		 69 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  55.88 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  62.12 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4033  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03357  hypothetical protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.58 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  54.93 
 
 		 69 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.94 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.878106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3877  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.76351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3929  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4932  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  54.93 
 
 		 69 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2213  cold shock-like protein CspC  57.75 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000972653  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4361  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.94 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.61 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3757  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3845  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.644384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  54.93 
 
 		 69 aa  83.6  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3970  major cold shock protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01793  stress protein, member of the CspA-family  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000145825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1820  cold-shock DNA-binding domain protein  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000376643  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 71 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1365  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000234098  normal  0.0150165 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.93 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2822  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000720852  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01781  hypothetical protein  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000220518  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1478  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000112944  normal  0.636634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1294  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000632959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1977  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000786929  normal  0.190727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1291  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.06 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.515471  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2498  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.35 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000241121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2554  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000000810099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1500  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.93 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1913  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2883  cold-shock DNA-binding domain protein  54.93 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808952 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0051  cold shock protein  57.14 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2474  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00166025  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2051  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2393  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  56.72 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  57.14 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2038  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000133144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1981  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000173649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5001  cold shock protein  56.34 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.56924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2089  cold shock-like protein CspC  56.34 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.57783e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>