140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2196 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2196  putative flagellar protein  100 
 
 		 130 aa  261  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  40.57 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  31.82 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  37.37 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  30 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  35.2 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  31 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  35.88 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  30.91 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  30.91 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  31.19 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  34.21 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  32 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  37.61 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  35.04 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  28.83 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  28.83 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  30 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50250  flagellar protein FliS  40.35 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194402  decreased coverage  0.0000900366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  28.18 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  29.09 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  35.35 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  32.71 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  36.7 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  35.78 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  35.78 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  33 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  29.63 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  34.26 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  28.18 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  33.63 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  32.48 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  33.63 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  28.83 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  32.48 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  32.48 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  32.48 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  34.86 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  32.48 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2832  flagellar protein FliS  34.58 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0132865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  28.83 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  30.53 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  31.93 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  30.23 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  30.36 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  28.85 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  27.93 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  29.92 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  31.31 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3936  flagellar protein FliS  31.58 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  25.83 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  25.21 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  29.6 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0202  flagellar protein FliS  34 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  29.01 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  30.23 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  32 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  29.23 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  28.83 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  30.48 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  28.83 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  32 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3463  flagellar protein FliS  29.92 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.220279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  32 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  28.69 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  32 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  32 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  32 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  32 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  29.09 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  29.66 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4375  flagellar protein FliS  29.75 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1952  flagellar protein FliS  28.93 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147939  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  28.18 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  29.52 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  30.56 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  25.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3700  flagellar protein FliS  31.2 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.687264  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  29.41 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  29.46 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  31 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  27.03 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  33.78 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  31 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  32.43 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  32 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  29.46 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  32 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  25.98 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>