125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2096 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
158 aa  320  6e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.97 
 
 
161 aa  97.4  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  42.06 
 
 
160 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.86 
 
 
162 aa  91.3  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  36.42 
 
 
161 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.51 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  35.8 
 
 
161 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  35.8 
 
 
161 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  35.8 
 
 
161 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  35.8 
 
 
161 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  38.62 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  38.89 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  36.65 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  39.51 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.42 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  39.13 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  35.62 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  35.8 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  34.57 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  35.4 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  35.19 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  35.19 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.19 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  35.19 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  35.19 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  35.19 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  35.19 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  35.19 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  36.29 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  38.1 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  39.19 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.18 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.58 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  35.19 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.42 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  31.94 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  32.41 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  30.63 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.97 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.2 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  34.4 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.86 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.82 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  38.57 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.19 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.19 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.19 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.43 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.51 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.51 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.51 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.81 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.51 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  32.3 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.48 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.86 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.01 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.58 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  31.37 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.89 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.2 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  33.85 
 
 
175 aa  57.4  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.22 
 
 
168 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.2 
 
 
163 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  30.72 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.67 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  33.6 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26931  phosphohistidine phosphatase SixA  29.75 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.66 
 
 
152 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.66 
 
 
153 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.09 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.16 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.83 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.07 
 
 
152 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  31.17 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.43 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.45 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.79 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.83 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.75 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.5 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.84 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.84 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.84 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.84 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.6 
 
 
165 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.6 
 
 
165 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.77 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.91 
 
 
164 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.83 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  30 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.48 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  27.5 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>