26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4704 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  687    Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  23.93 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  24.15 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  20.67 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  24.23 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  23.41 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  25.82 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  22.26 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  24.04 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  24.59 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  21.91 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  21.91 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  21.91 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  21.91 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  21.91 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  21.91 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  23.35 
 
 		 384 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  25.22 
 
 		 372 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  21.33 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  21.96 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  21.96 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  22.67 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  21.72 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>