More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4355 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
174 aa  361  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  95.98 
 
 
174 aa  334  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  97.13 
 
 
174 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  87.86 
 
 
174 aa  320  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  69.94 
 
 
182 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.48 
 
 
177 aa  254  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.73 
 
 
188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  43.03 
 
 
178 aa  168  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  41.82 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  41.88 
 
 
170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  42.57 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  40 
 
 
183 aa  134  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  39.62 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  36.36 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  35.76 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.74 
 
 
183 aa  114  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  33.73 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  33.73 
 
 
168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  33.14 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
184 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  25.77 
 
 
164 aa  101  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  33.12 
 
 
223 aa  100  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  33.97 
 
 
184 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.84 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  28.3 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  29.17 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.95 
 
 
179 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  32.61 
 
 
165 aa  87.4  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  28.66 
 
 
170 aa  87.4  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  40.37 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.06 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.19 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  25.79 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  23.03 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12893  soluble secreted antigen mpt53 precursor  30.08 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  27.12 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1410  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  31.58 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459055  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.01 
 
 
422 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  31.48 
 
 
269 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  29.91 
 
 
279 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.82 
 
 
355 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  23.68 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  26.27 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  30.3 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3362  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.23 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  29.69 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  30 
 
 
172 aa  52  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  28.21 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  23.08 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  32.04 
 
 
182 aa  51.6  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  24.5 
 
 
201 aa  51.2  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  29.25 
 
 
278 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  32.99 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  27.33 
 
 
184 aa  51.2  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  24.44 
 
 
170 aa  51.2  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  29.29 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.43 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  25 
 
 
403 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  24.27 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  26.8 
 
 
433 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.31 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  22.99 
 
 
403 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  29.55 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  28.3 
 
 
278 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  26.32 
 
 
114 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  30.84 
 
 
106 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.82 
 
 
446 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  29.52 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.24 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.93 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  22.88 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  25.93 
 
 
109 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.14 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.49 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  27.52 
 
 
109 aa  48.5  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  29.31 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  25.96 
 
 
133 aa  48.5  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  29.35 
 
 
100 aa  48.9  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  27.08 
 
 
107 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  26.55 
 
 
108 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  27.78 
 
 
135 aa  48.5  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.83 
 
 
409 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  28.07 
 
 
119 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  27.35 
 
 
173 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.93 
 
 
201 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  23.28 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.04 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.64 
 
 
175 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.31 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  27.27 
 
 
105 aa  48.1  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  25.71 
 
 
102 aa  48.1  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1597  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.62 
 
 
650 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1325  Redoxin domain protein  23.81 
 
 
189 aa  48.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.855613  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  26.45 
 
 
197 aa  47.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45300  cytochrome C biogenesis protein CcmG  29.6 
 
 
180 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  29.35 
 
 
103 aa  47.8  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  26.13 
 
 
108 aa  47.8  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>