More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0335 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0329  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  81.23 
 
 
405 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.82571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0338  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  97.74 
 
 
399 aa  804    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0335  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  100 
 
 
406 aa  838    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4380  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.49 
 
 
405 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0330  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  97.78 
 
 
406 aa  823    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0328  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  97.24 
 
 
399 aa  802    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0338  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.84 
 
 
407 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3688  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.84 
 
 
407 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0434  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  93.55 
 
 
405 aa  782    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0340  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  73 
 
 
400 aa  588  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4609  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  68.26 
 
 
397 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.753979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3391  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  71.36 
 
 
401 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0313  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  67.17 
 
 
401 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000546627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3900  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  65.83 
 
 
432 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  65.49 
 
 
401 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0425  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  55.75 
 
 
398 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2092  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  54.43 
 
 
401 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5107  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II, putative  52.28 
 
 
398 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3054  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  52.66 
 
 
393 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193367  normal  0.24472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0425  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  52.17 
 
 
398 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4083  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  52.75 
 
 
395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00773  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  51.9 
 
 
395 aa  362  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3694  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  51.01 
 
 
393 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4771  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  51.01 
 
 
393 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.36259  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0700  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.85 
 
 
393 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3608  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  52.25 
 
 
395 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0937  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  51.9 
 
 
393 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004075  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase FabV inferred for ABFAE pathway  51.67 
 
 
395 aa  348  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1499  Beta-ketoacyl synthase  48.47 
 
 
390 aa  345  6e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3911  Beta-ketoacyl synthase  50.13 
 
 
394 aa  341  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739075  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3885  Beta-ketoacyl synthase  49.1 
 
 
380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4811  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  45.71 
 
 
389 aa  324  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4579  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.73 
 
 
385 aa  322  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3896  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  44.56 
 
 
389 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0900  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.58 
 
 
389 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.937274  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4389  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  49 
 
 
396 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0220453  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3984  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.08 
 
 
397 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2758  beta-ketoacyl synthase  47.33 
 
 
396 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.759719  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0427  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.73 
 
 
405 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.65749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0315  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.58 
 
 
405 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14023  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1371  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  49.57 
 
 
365 aa  279  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0303  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  44.95 
 
 
405 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2239  Beta-ketoacyl synthase  47.97 
 
 
415 aa  275  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4185  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.11 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.875277 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2152  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.88 
 
 
423 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2766  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.88 
 
 
423 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2818  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.88 
 
 
407 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3927  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.63 
 
 
416 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0917605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2685  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.31 
 
 
407 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0939  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.11 
 
 
397 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0796  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.11 
 
 
397 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2166  MatE efflux family protein  38.73 
 
 
388 aa  256  7e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6096  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  45.6 
 
 
403 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1245  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  42.18 
 
 
408 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1215  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  42.25 
 
 
408 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.609647  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1166  general stress protein 14 (GSP14)  41.48 
 
 
374 aa  251  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.41 
 
 
394 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0242987  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0105  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase (beta-ketoacyl-ACP synthase)  40.24 
 
 
405 aa  245  8e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0262  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  42.53 
 
 
400 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2753  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  45.56 
 
 
406 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02883  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  42.98 
 
 
399 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0475  Beta-ketoacyl synthase  44.54 
 
 
394 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0924  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.84 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0431  Beta-ketoacyl synthase  34.5 
 
 
390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2115  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] synthase  33.97 
 
 
402 aa  199  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5803  Beta-ketoacyl synthase  43.17 
 
 
398 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877153  normal  0.558575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1866  Beta-ketoacyl synthase  35.76 
 
 
404 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0173  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  32.3 
 
 
414 aa  186  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1989  Beta-ketoacyl synthase  33.42 
 
 
394 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1182  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  34.52 
 
 
415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000254135  decreased coverage  0.00170514 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03865  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) synthase  33.73 
 
 
400 aa  182  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1764  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  32.24 
 
 
418 aa  182  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1194  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  31.25 
 
 
423 aa  180  4e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6844  Beta-ketoacyl synthase  33.18 
 
 
404 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  39.72 
 
 
395 aa  179  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0494266  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0178  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  31.12 
 
 
414 aa  179  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000821615  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0745  Beta-ketoacyl synthase  34.72 
 
 
399 aa  178  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2650  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  36.65 
 
 
395 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
600 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3357  Beta-ketoacyl synthase  31.15 
 
 
418 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946048  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0882  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  32 
 
 
422 aa  172  6.999999999999999e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.319749  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0165  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  30.86 
 
 
418 aa  172  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0129  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  31.28 
 
 
417 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100569  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2180  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  31.57 
 
 
420 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1088  beta-ketoacyl synthase  31.76 
 
 
399 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0216  Beta-ketoacyl synthase  35.54 
 
 
812 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2904  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  31.09 
 
 
420 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.421653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2977  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  32.27 
 
 
421 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270914  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0926  beta-ketoacyl synthase  32.92 
 
 
392 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1207  hypothetical protein  30.82 
 
 
418 aa  169  7e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000145703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5649  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  33.33 
 
 
417 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.584873  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1721  beta-ketoacyl synthase  32.46 
 
 
409 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000983159  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1528  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  31.87 
 
 
422 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2863  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  30.88 
 
 
415 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0132875  hitchhiker  0.00789188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1625  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  38.97 
 
 
412 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000300702  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0945  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  31.52 
 
 
413 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0460  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  33.25 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0842196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2494  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  32.63 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1346  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  31.84 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2672  beta-ketoacyl synthase  34.83 
 
 
410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464493  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>