More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0900 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0900  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  100 
 
 
389 aa  783    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.937274  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4811  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  64.77 
 
 
389 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3896  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  65.28 
 
 
389 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4579  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  64.25 
 
 
385 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2092  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  51.79 
 
 
401 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004075  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase FabV inferred for ABFAE pathway  50.9 
 
 
395 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00773  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  51.93 
 
 
395 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4083  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  51.92 
 
 
395 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3608  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  51.66 
 
 
395 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3694  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  50.39 
 
 
393 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4771  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  50.39 
 
 
393 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.36259  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3900  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.99 
 
 
432 aa  342  8e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5107  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II, putative  48.35 
 
 
398 aa  338  7e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0434  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.98 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0425  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.62 
 
 
398 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0338  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.48 
 
 
399 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0328  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.22 
 
 
399 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4609  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.22 
 
 
397 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.753979 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3911  Beta-ketoacyl synthase  51.93 
 
 
394 aa  329  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739075  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0330  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.22 
 
 
406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0313  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.47 
 
 
401 aa  328  8e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000546627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4380  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.61 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0329  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.99 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.82571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0335  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.97 
 
 
406 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0425  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.01 
 
 
398 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3391  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.84 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0700  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.92 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0338  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.5 
 
 
407 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3054  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.97 
 
 
393 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193367  normal  0.24472 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3688  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.5 
 
 
407 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1499  Beta-ketoacyl synthase  45.5 
 
 
390 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0340  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.43 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0937  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  49.23 
 
 
393 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4389  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  46.95 
 
 
396 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0220453  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.7 
 
 
401 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3885  Beta-ketoacyl synthase  43.68 
 
 
380 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3927  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  50 
 
 
416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0917605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2685  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.97 
 
 
407 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2239  Beta-ketoacyl synthase  46.94 
 
 
415 aa  275  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2818  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.17 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0427  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.47 
 
 
405 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.65749 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2152  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.84 
 
 
423 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2766  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.84 
 
 
423 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4185  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  43.42 
 
 
404 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.875277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0262  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.63 
 
 
400 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0315  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.93 
 
 
405 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14023  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0303  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.93 
 
 
405 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6096  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.97 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3984  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  44.96 
 
 
397 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2753  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.03 
 
 
406 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1371  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.03 
 
 
365 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2758  beta-ketoacyl synthase  47.92 
 
 
396 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.759719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0924  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.31 
 
 
396 aa  243  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1166  general stress protein 14 (GSP14)  40.32 
 
 
374 aa  243  6e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02883  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  44.11 
 
 
399 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0105  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase (beta-ketoacyl-ACP synthase)  39.01 
 
 
405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0796  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  45 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0939  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  45 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2166  MatE efflux family protein  37.06 
 
 
388 aa  231  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0475  Beta-ketoacyl synthase  44.29 
 
 
394 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.89 
 
 
394 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0242987  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0431  Beta-ketoacyl synthase  33.5 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1245  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  42.15 
 
 
408 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1215  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  42.31 
 
 
408 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.609647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03865  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) synthase  36.21 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2115  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] synthase  36.87 
 
 
402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1989  Beta-ketoacyl synthase  35.31 
 
 
394 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5803  Beta-ketoacyl synthase  36.59 
 
 
398 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877153  normal  0.558575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0745  Beta-ketoacyl synthase  39.53 
 
 
399 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  33.25 
 
 
395 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0494266  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0671  cylI protein  32.84 
 
 
731 aa  182  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6844  Beta-ketoacyl synthase  42.11 
 
 
404 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2650  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  37.28 
 
 
395 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1088  beta-ketoacyl synthase  32.52 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1695  Beta-ketoacyl synthase  42.28 
 
 
401 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2123  Beta-ketoacyl synthase  43.28 
 
 
371 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1866  Beta-ketoacyl synthase  31.5 
 
 
404 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0926  beta-ketoacyl synthase  37.39 
 
 
392 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3606  beta-ketoacyl synthase  36.33 
 
 
416 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0193  Beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 
407 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0945  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  36.98 
 
 
413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0460  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  36.72 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0842196  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1194  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  38.61 
 
 
423 aa  159  6e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2193  Beta-ketoacyl synthase  43.6 
 
 
409 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.441791  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1320  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  29.71 
 
 
415 aa  157  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.321094  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1764  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  31.04 
 
 
418 aa  156  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1182  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  36.33 
 
 
415 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000254135  decreased coverage  0.00170514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1346  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  30.68 
 
 
413 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1603  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  32.41 
 
 
410 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0116362  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10310  Beta-ketoacyl synthase  29.91 
 
 
415 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00489291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1375  beta-ketoacyl synthase  34.94 
 
 
418 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0089  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  38.17 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1054  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  39.16 
 
 
422 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1071  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  38.58 
 
 
420 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.150702  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1934  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  36.86 
 
 
410 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2564  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  37.97 
 
 
412 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2461  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  32 
 
 
411 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0850761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0893  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  37.59 
 
 
419 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1606  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  30.97 
 
 
412 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0218  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  38.1 
 
 
422 aa  150  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>