More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2685 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0427  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  79.95 
 
 
405 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.65749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0315  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.25 
 
 
405 aa  638    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14023  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6096  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  90.82 
 
 
403 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0303  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80 
 
 
405 aa  634    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2152  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  90.23 
 
 
423 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2685  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  100 
 
 
407 aa  809    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2818  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  97.3 
 
 
407 aa  765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2766  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  90.23 
 
 
423 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3927  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  70.4 
 
 
416 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0917605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2753  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  70.1 
 
 
406 aa  496  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4185  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.75 
 
 
404 aa  490  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.875277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3984  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.81 
 
 
397 aa  481  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1371  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.75 
 
 
365 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179852 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0796  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.15 
 
 
397 aa  461  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0939  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.15 
 
 
397 aa  461  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0924  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  65.08 
 
 
396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2239  Beta-ketoacyl synthase  57.04 
 
 
415 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.9 
 
 
394 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0242987  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0262  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  53.71 
 
 
400 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0475  Beta-ketoacyl synthase  54.04 
 
 
394 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1245  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.67 
 
 
408 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1215  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.67 
 
 
408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.609647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02883  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.76 
 
 
399 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3900  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  44.66 
 
 
432 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2092  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.61 
 
 
401 aa  289  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0335  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.88 
 
 
406 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0900  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.88 
 
 
389 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.937274  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0330  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.88 
 
 
406 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0338  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.31 
 
 
399 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0434  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.31 
 
 
405 aa  275  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0328  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.59 
 
 
399 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3391  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.26 
 
 
401 aa  270  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0313  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.97 
 
 
401 aa  269  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000546627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4609  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  41.75 
 
 
397 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.753979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0340  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  44.41 
 
 
400 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4380  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.58 
 
 
405 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0338  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.86 
 
 
407 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0329  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.86 
 
 
405 aa  262  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.82571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3688  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.86 
 
 
407 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004075  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase FabV inferred for ABFAE pathway  47.35 
 
 
395 aa  262  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4579  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  43 
 
 
385 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4083  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.33 
 
 
395 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.02 
 
 
401 aa  247  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5107  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II, putative  46.51 
 
 
398 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3608  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.78 
 
 
395 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3911  Beta-ketoacyl synthase  48.66 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739075  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4811  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  44.32 
 
 
389 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1499  Beta-ketoacyl synthase  43.82 
 
 
390 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3885  Beta-ketoacyl synthase  45.97 
 
 
380 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3896  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  42.47 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0425  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.8 
 
 
398 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0425  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.37 
 
 
398 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4389  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  44.57 
 
 
396 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0220453  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_003296  RS00773  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.36 
 
 
395 aa  229  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3054  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  44.88 
 
 
393 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193367  normal  0.24472 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3694  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  45.2 
 
 
393 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4771  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  45.2 
 
 
393 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.36259  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2758  beta-ketoacyl synthase  51.77 
 
 
396 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.759719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0700  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  42.54 
 
 
393 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0937  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  45.71 
 
 
393 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2650  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  40.98 
 
 
395 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1166  general stress protein 14 (GSP14)  35.53 
 
 
374 aa  205  9e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5649  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  39.94 
 
 
417 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.584873  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1989  Beta-ketoacyl synthase  36.73 
 
 
394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2166  MatE efflux family protein  36.95 
 
 
388 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2123  Beta-ketoacyl synthase  38.59 
 
 
371 aa  195  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0460  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  35.99 
 
 
401 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0842196  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1999  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  43.3 
 
 
401 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2115  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] synthase  36.86 
 
 
402 aa  190  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0379  Beta-ketoacyl synthase  43.12 
 
 
415 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0431  Beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 
390 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1158  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  38.02 
 
 
412 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000732575  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0125  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  35.05 
 
 
415 aa  187  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.888251  normal  0.0110031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1358  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  33.65 
 
 
473 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20611  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  41.54 
 
 
415 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1186  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  41.54 
 
 
415 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0591996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0216  Beta-ketoacyl synthase  41.97 
 
 
812 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5803  Beta-ketoacyl synthase  39.53 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877153  normal  0.558575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0745  Beta-ketoacyl synthase  33.25 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4603  beta-ketoacyl synthase  42.91 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2690  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  36.36 
 
 
432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17341  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  39.3 
 
 
415 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2977  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  39.37 
 
 
421 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270914  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0089  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  41.64 
 
 
421 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1833  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
412 aa  182  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0449277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1606  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  35.78 
 
 
412 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0169  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  35.86 
 
 
415 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3606  beta-ketoacyl synthase  32.35 
 
 
416 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1686  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  40.89 
 
 
421 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.619809  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0750  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  35.78 
 
 
413 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000685785  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0105  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase (beta-ketoacyl-ACP synthase)  36.65 
 
 
405 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1695  Beta-ketoacyl synthase  34.35 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2806  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  42.69 
 
 
413 aa  180  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000450651  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1076  Beta-ketoacyl synthase  37.77 
 
 
415 aa  180  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2469  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  38.1 
 
 
421 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0437  beta-ketoacyl synthase  39.08 
 
 
414 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.43987  normal  0.135103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1375  beta-ketoacyl synthase  38.29 
 
 
418 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  37.62 
 
 
410 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0003  beta-ketoacyl synthase  45.04 
 
 
385 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000106531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2351  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  40.89 
 
 
421 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>