More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1280 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  72.85 
 
 
291 aa  447  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  47.3 
 
 
293 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  46.26 
 
 
293 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  45.39 
 
 
293 aa  258  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  45.05 
 
 
293 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  45.05 
 
 
293 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  45.05 
 
 
293 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  45.05 
 
 
293 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  45.05 
 
 
293 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  45.05 
 
 
293 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  45.05 
 
 
293 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  45.76 
 
 
293 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  44.37 
 
 
293 aa  255  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  44.37 
 
 
293 aa  255  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  42.57 
 
 
307 aa  249  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  43.06 
 
 
290 aa  248  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  44.79 
 
 
290 aa  246  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  44.64 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  42.57 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.8 
 
 
296 aa  229  3e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.38 
 
 
290 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.63 
 
 
294 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.35 
 
 
293 aa  195  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.23 
 
 
288 aa  193  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.46 
 
 
292 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.86 
 
 
291 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  40.6 
 
 
287 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  40.23 
 
 
287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.86 
 
 
305 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  41.49 
 
 
279 aa  187  2e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.97 
 
 
292 aa  181  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.57 
 
 
296 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.36 
 
 
293 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.1 
 
 
292 aa  175  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.74 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.86 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.75 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.56 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.14 
 
 
282 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.29 
 
 
293 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  34.56 
 
 
298 aa  171  2e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.15 
 
 
290 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.29 
 
 
295 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  36.21 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.11 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 
300 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.95 
 
 
301 aa  161  1e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  36.09 
 
 
315 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  35.25 
 
 
294 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.39 
 
 
319 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  33.66 
 
 
311 aa  158  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33 
 
 
296 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.72 
 
 
293 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  33.58 
 
 
350 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.42 
 
 
300 aa  155  1e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  34.22 
 
 
325 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.53 
 
 
306 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2576  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 
323 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0905  ribosome-associated GTPase  34.02 
 
 
324 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.43 
 
 
319 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  34.75 
 
 
370 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  32.55 
 
 
313 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  32.55 
 
 
313 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  37.45 
 
 
405 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 
314 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 
314 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  37.45 
 
 
376 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 
314 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.57 
 
 
370 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  32.33 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 
314 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 
313 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 
314 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 
314 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 
313 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 
314 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  33.85 
 
 
350 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  31.48 
 
 
314 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  36.67 
 
 
312 aa  143  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.77 
 
 
375 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  37.7 
 
 
380 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  33.58 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  31.47 
 
 
289 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  34.47 
 
 
374 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0099  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.38 
 
 
350 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  32.38 
 
 
350 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  32.03 
 
 
350 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  32.03 
 
 
350 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  32.03 
 
 
350 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  32.03 
 
 
350 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  32.03 
 
 
350 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  32.03 
 
 
350 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  31.79 
 
 
315 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>