More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1600 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1600  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
468 aa  899    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.298704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4799  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.26 
 
 
449 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
469 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
477 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  32.48 
 
 
469 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  34.06 
 
 
476 aa  202  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  33.97 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  33.12 
 
 
468 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
488 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  34.06 
 
 
481 aa  193  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
467 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
476 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
487 aa  189  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  32.47 
 
 
467 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
502 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  32.47 
 
 
467 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
481 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
462 aa  182  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
515 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
468 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
477 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  30.21 
 
 
460 aa  172  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
489 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  31.24 
 
 
486 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
486 aa  169  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
486 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
472 aa  167  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
482 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
448 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
458 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
469 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  35.13 
 
 
499 aa  153  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
465 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  28.85 
 
 
476 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 
466 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
464 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
468 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
533 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
499 aa  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
492 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  30.51 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  31.49 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  30.19 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
480 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
476 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
463 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
461 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2038  histidine kinase  29.97 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
463 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  29.01 
 
 
457 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
419 aa  126  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
386 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
468 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
499 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
465 aa  123  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
472 aa  120  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
469 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  28.9 
 
 
445 aa  114  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.94 
 
 
415 aa  114  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  34.39 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  28.73 
 
 
463 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  30 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  29.59 
 
 
431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
452 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  32.94 
 
 
465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
463 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
463 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  34.52 
 
 
408 aa  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  32.4 
 
 
465 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
413 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.34 
 
 
447 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.17 
 
 
457 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
418 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
461 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
438 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1406 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
586 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 
455 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>