More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1889 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  53.89 
 
 
830 aa  753    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1889  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
860 aa  1675    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0471823  normal  0.0591915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2855  AMP-dependent synthetase and ligase  52.32 
 
 
829 aa  757    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  56.32 
 
 
889 aa  824    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.813754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5341  AMP-dependent synthetase and ligase  55.06 
 
 
915 aa  802    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1979  AMP-dependent synthetase and ligase  54.13 
 
 
830 aa  753    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2121  AMP-dependent synthetase and ligase  52.96 
 
 
868 aa  812    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5747  AMP-dependent synthetase and ligase  52.41 
 
 
831 aa  756    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2025  AMP-dependent synthetase and ligase  54.13 
 
 
830 aa  753    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  52.29 
 
 
862 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0560008  normal  0.885424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4142  AMP-dependent synthetase and ligase  52.78 
 
 
860 aa  722    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2019  AMP-dependent synthetase and ligase  46.96 
 
 
841 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00459182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0772  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 
887 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0989084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2621  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 
453 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2512  AMP-dependent synthetase and ligase  37.07 
 
 
460 aa  264  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.280527  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2843  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 
459 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0145799  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3177  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 
471 aa  221  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 
490 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 
497 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 
534 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 
523 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 
530 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 
523 aa  181  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 
418 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2563  antibiotic biosynthesis protein, putative  28.89 
 
 
923 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136066  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3152  amino acid adenylation domain-containing protein  28.89 
 
 
923 aa  167  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3314  amino acid adenylation domain-containing protein  29.65 
 
 
923 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105674  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
526 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 
520 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 
517 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.14 
 
 
492 aa  150  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  36.34 
 
 
521 aa  150  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 
514 aa  149  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 
520 aa  147  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 
526 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 
519 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 
527 aa  131  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 
515 aa  128  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 
529 aa  127  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 
523 aa  127  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  31.69 
 
 
4290 aa  126  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 
512 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 
505 aa  125  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  34.86 
 
 
535 aa  124  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  34.86 
 
 
535 aa  124  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  34.86 
 
 
535 aa  124  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  34.86 
 
 
535 aa  124  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  34.86 
 
 
608 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  34.86 
 
 
691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3277  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  34.72 
 
 
719 aa  123  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 
514 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 
531 aa  122  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3223  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.95 
 
 
719 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229398 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 
529 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3157  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.95 
 
 
719 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.141461  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  32.19 
 
 
4489 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  31.5 
 
 
8211 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3175  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.95 
 
 
719 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3238  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.68 
 
 
719 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000871446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3338  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.95 
 
 
719 aa  121  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0125057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 
505 aa  121  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  33.25 
 
 
505 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 
545 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 
510 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 
523 aa  119  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  33.42 
 
 
536 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
512 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.73 
 
 
510 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.51 
 
 
510 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 
509 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 
538 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.51 
 
 
510 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.51 
 
 
510 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.51 
 
 
510 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.42 
 
 
510 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02684  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  33.25 
 
 
719 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.379527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0854  AMP-dependent synthetase and ligase  33.25 
 
 
719 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2984  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.25 
 
 
719 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272141  normal  0.0211518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02645  hypothetical protein  33.25 
 
 
719 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337206  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4103  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.25 
 
 
719 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.022489  hitchhiker  0.000184604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0879  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.25 
 
 
719 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.513346  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.51 
 
 
510 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.73 
 
 
510 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2983  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.25 
 
 
719 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0560212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3156  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.25 
 
 
719 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.344135  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 
536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3026  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.42 
 
 
719 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.4 
 
 
510 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.32 
 
 
510 aa  115  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 
553 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.31 
 
 
530 aa  115  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.51 
 
 
510 aa  115  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.87 
 
 
529 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 
553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.31 
 
 
539 aa  112  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 
585 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.38 
 
 
2385 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 
583 aa  111  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  36.24 
 
 
570 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 
538 aa  111  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>