47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0670 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  353  6.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  50.53 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  48.94 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  35.64 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  45.98 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  44.62 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  44.62 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  44.62 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  48.28 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  48.57 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  48.57 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  48.57 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  41.33 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0672  hypothetical protein  40.51 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  38.27 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0726  hypothetical protein  35.62 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  34.71 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  42.7 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  34.32 
 
 		 249 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  35.83 
 
 		 236 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  34.91 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  36 
 
 		 484 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  32.47 
 
 		 94 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  39.47 
 
 		 1093 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  39.47 
 
 		 1089 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  39.47 
 
 		 1093 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  35.48 
 
 		 105 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  31.95 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2686  hypothetical protein  35.71 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  38.55 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0744  hypothetical protein  37.14 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  38.89 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2142  hypothetical protein  38.67 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00810  hypothetical protein  36 
 
 		 95 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.471947  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  34.95 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  38.71 
 
 		 521 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  30.61 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 		 594 aa  44.3  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  32.56 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  36.15 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0942  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  35.63 
 
 		 1110 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1138  hypothetical protein  47.83 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2843  hypothetical protein  36.59 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2057  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  33.78 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>