40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3503 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  53.6 
 
 		 848 aa  882    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.46 
 
 		 850 aa  875    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 831 aa  1706    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  56.2 
 
 		 848 aa  918    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.68 
 
 		 845 aa  888    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.8 
 
 		 852 aa  627  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  38.45 
 
 		 858 aa  591  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  38.35 
 
 		 885 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.02 
 
 		 862 aa  502  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  33.33 
 
 		 836 aa  498  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  32.59 
 
 		 871 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.03 
 
 		 863 aa  422  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.83 
 
 		 860 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.92 
 
 		 829 aa  314  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  26.82 
 
 		 823 aa  309  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  26.96 
 
 		 816 aa  306  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.95 
 
 		 834 aa  303  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.48 
 
 		 837 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.23 
 
 		 911 aa  235  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.06 
 
 		 887 aa  228  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1057 aa  207  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  25.58 
 
 		 840 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.57 
 
 		 874 aa  98.6  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  25.15 
 
 		 932 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.61 
 
 		 942 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  25.74 
 
 		 983 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.28 
 
 		 910 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  25.33 
 
 		 923 aa  64.7  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.1 
 
 		 923 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  23.47 
 
 		 906 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.84 
 
 		 526 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  24.29 
 
 		 931 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.97 
 
 		 606 aa  51.6  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.97 
 
 		 606 aa  51.6  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.48 
 
 		 618 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.51 
 
 		 615 aa  47.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.94 
 
 		 580 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  20.6 
 
 		 541 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.32 
 
 		 609 aa  45.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.7 
 
 		 631 aa  44.3  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>