94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2783 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  74.17 
 
 
304 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  73.84 
 
 
304 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  74.17 
 
 
304 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  73.84 
 
 
304 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  72.85 
 
 
304 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  72.19 
 
 
304 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  74.33 
 
 
311 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  72.19 
 
 
304 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  71.85 
 
 
304 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  72.48 
 
 
316 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  71.62 
 
 
309 aa  425  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  70.75 
 
 
315 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  73.1 
 
 
292 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  69.23 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  67.22 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  64.14 
 
 
305 aa  388  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  67.03 
 
 
308 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  63.36 
 
 
293 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  59.36 
 
 
306 aa  342  2.9999999999999997e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  56.07 
 
 
312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  49.67 
 
 
329 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  53.04 
 
 
309 aa  288  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  49.14 
 
 
294 aa  278  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  45.19 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  46.26 
 
 
314 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  43.71 
 
 
307 aa  240  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  46.42 
 
 
309 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  47.77 
 
 
317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  44.14 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  42.11 
 
 
341 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  42.35 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  44.29 
 
 
294 aa  215  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  45.03 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  43.66 
 
 
324 aa  202  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  39.39 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  39.73 
 
 
330 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  38.36 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  41.53 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  36.01 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  44.18 
 
 
297 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  41.2 
 
 
292 aa  162  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  31.15 
 
 
342 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  39.08 
 
 
290 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  34.54 
 
 
320 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  34.36 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  34.78 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  32.3 
 
 
305 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  34.55 
 
 
565 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  33.46 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  34.15 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  34.15 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  34.15 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  35.71 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  34.15 
 
 
268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  34.15 
 
 
268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  34.15 
 
 
268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  34.15 
 
 
268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  32.93 
 
 
268 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  38.27 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  35.37 
 
 
278 aa  112  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  33.76 
 
 
253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  32.93 
 
 
268 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  33.6 
 
 
355 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  34.82 
 
 
309 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  30.47 
 
 
318 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  31.58 
 
 
334 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  31.25 
 
 
279 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  29.93 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  29.93 
 
 
303 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  31.3 
 
 
286 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  34.07 
 
 
286 aa  95.9  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  31.75 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  34.43 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  31.75 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  36.02 
 
 
320 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  28.85 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  28.69 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  29.25 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  29.27 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  29.48 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  27.94 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  28.69 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  29.86 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  26.62 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  30.42 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  28.34 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  25.88 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2720  membrane protein-like protein  31.82 
 
 
183 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1510  protein of unknown function DUF368  24.9 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0187  protein of unknown function DUF368  24.62 
 
 
289 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>