More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0782 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3126  aminopeptidase B  80.42 
 
 
430 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0275669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3127  aminopeptidase B  76 
 
 
425 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.353364  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0876  aminopeptidase B  79.48 
 
 
430 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3488  aminopeptidase B  80.66 
 
 
430 aa  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0874  aminopeptidase B  80.42 
 
 
430 aa  684    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0348435  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3796  aminopeptidase B  75.29 
 
 
425 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.103934  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3897  aminopeptidase B  77.41 
 
 
425 aa  663    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000551018  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3168  aminopeptidase B  77.25 
 
 
425 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000320963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0886  aminopeptidase B  80.19 
 
 
430 aa  682    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154552  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0851  aminopeptidase B  80.9 
 
 
430 aa  687    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0564322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0732  aminopeptidase B  80.19 
 
 
430 aa  679    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.354298  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3290  aminopeptidase B  80.42 
 
 
430 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0811496  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3274  aminopeptidase B  76.01 
 
 
424 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00646362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3402  aminopeptidase B  80.42 
 
 
430 aa  682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329172  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0782  aminopeptidase B  100 
 
 
427 aa  866    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0700  aminopeptidase B  74.76 
 
 
425 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0481686  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03542  aminopeptidase B  58.59 
 
 
427 aa  451  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3939  aminopeptidase B  57.24 
 
 
427 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0177872  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0284  aminopeptidase B  52.93 
 
 
444 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000940358  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01063  aminopeptidase B  53.02 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1331  aminopeptidase B  51.86 
 
 
430 aa  398  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  52.33 
 
 
432 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  50.35 
 
 
427 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  50.12 
 
 
427 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  50.12 
 
 
427 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  50.12 
 
 
427 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  50.12 
 
 
427 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  49.88 
 
 
427 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  49.88 
 
 
427 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0724  aminopeptidase B  49.77 
 
 
428 aa  388  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  50.12 
 
 
427 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  50.35 
 
 
428 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  50.12 
 
 
431 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  49.88 
 
 
427 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  50.12 
 
 
427 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  50.12 
 
 
427 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  50.12 
 
 
427 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  49.88 
 
 
427 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  49.88 
 
 
427 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  49.07 
 
 
436 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  49.65 
 
 
431 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  50.12 
 
 
431 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0388  aminopeptidase B  48.25 
 
 
432 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  49.3 
 
 
436 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  50.12 
 
 
432 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  50.12 
 
 
432 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  50.12 
 
 
432 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  45.34 
 
 
524 aa  226  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  38.92 
 
 
512 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  40.37 
 
 
496 aa  213  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  40.06 
 
 
491 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  45.35 
 
 
503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  36.66 
 
 
510 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  38.32 
 
 
506 aa  196  9e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  38.51 
 
 
492 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  36.66 
 
 
510 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  36.66 
 
 
510 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  35.93 
 
 
474 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  40.12 
 
 
482 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  40 
 
 
463 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4642  Leucyl aminopeptidase  41.32 
 
 
480 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 
463 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  43.54 
 
 
511 aa  193  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  37.31 
 
 
511 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  37.31 
 
 
511 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 
510 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  40.54 
 
 
490 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  37.31 
 
 
511 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  41.33 
 
 
497 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  37.61 
 
 
502 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  41.75 
 
 
481 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  39.08 
 
 
496 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  39.32 
 
 
493 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  38.99 
 
 
521 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  41.61 
 
 
455 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  39.64 
 
 
495 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
461 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  40.84 
 
 
492 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2325  Leucyl aminopeptidase  41.95 
 
 
501 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  39.1 
 
 
515 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  40.59 
 
 
472 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
518 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  38.32 
 
 
511 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5066  leucyl aminopeptidase  39.31 
 
 
494 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  41.7 
 
 
503 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5060  leucyl aminopeptidase  39.31 
 
 
494 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4653  leucyl aminopeptidase  39.31 
 
 
494 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  37.83 
 
 
512 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  37.8 
 
 
493 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2206  Leucyl aminopeptidase  38.7 
 
 
501 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00206778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4792  leucyl aminopeptidase  38.99 
 
 
494 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5155  leucyl aminopeptidase  38.99 
 
 
494 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5032  leucyl aminopeptidase  38.99 
 
 
494 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04810  leucyl aminopeptidase  40.49 
 
 
512 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.388112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  39.06 
 
 
503 aa  186  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0678  leucyl aminopeptidase  33.33 
 
 
483 aa  186  7e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4633  leucyl aminopeptidase  38.99 
 
 
494 aa  186  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3532  leucyl aminopeptidase  38.24 
 
 
493 aa  186  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  41.36 
 
 
501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2029  Leucyl aminopeptidase  41.85 
 
 
499 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0427313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>