More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04810 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_04810  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
512 aa  1014    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.388112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2612  Leucyl aminopeptidase  55.73 
 
 
496 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.240488  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  44.76 
 
 
482 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  43.85 
 
 
501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  41.65 
 
 
491 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 
497 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  39.47 
 
 
495 aa  300  4e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0724  Leucyl aminopeptidase  50.26 
 
 
455 aa  295  2e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  41.06 
 
 
488 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  41.28 
 
 
492 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  43.7 
 
 
479 aa  292  8e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  43.95 
 
 
490 aa  292  8e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  39.57 
 
 
496 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  35.48 
 
 
504 aa  289  7e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  41.05 
 
 
487 aa  289  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  44.97 
 
 
491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  42 
 
 
497 aa  287  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  38.27 
 
 
503 aa  286  7e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  41.08 
 
 
496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  38.18 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  39.88 
 
 
528 aa  282  9e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  42.28 
 
 
507 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  39.06 
 
 
496 aa  280  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  39.91 
 
 
507 aa  279  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  39.58 
 
 
488 aa  279  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  38.99 
 
 
511 aa  279  9e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  38.17 
 
 
496 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  40.89 
 
 
495 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3861  leucyl aminopeptidase  36.61 
 
 
491 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3910  leucyl aminopeptidase  36.61 
 
 
491 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.723186  normal  0.561505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15490  leucyl aminopeptidase  43.14 
 
 
493 aa  276  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  33.63 
 
 
488 aa  276  5e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  43.15 
 
 
503 aa  276  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  38.57 
 
 
501 aa  276  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  39.78 
 
 
518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  42.54 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  38.43 
 
 
493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  37.79 
 
 
492 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  39.01 
 
 
496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1710  Leucyl aminopeptidase  41.2 
 
 
501 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.055191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  38.85 
 
 
496 aa  273  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  35.74 
 
 
493 aa  273  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13861  leucyl aminopeptidase  37.75 
 
 
493 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0993846  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2306  leucyl aminopeptidase  40.93 
 
 
497 aa  272  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.942842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  42.89 
 
 
498 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0566  leucyl aminopeptidase  39.63 
 
 
478 aa  271  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  39.18 
 
 
508 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  39.87 
 
 
511 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  37.61 
 
 
496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0954  leucyl aminopeptidase  39.36 
 
 
508 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  35.39 
 
 
495 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  39.02 
 
 
497 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  42.98 
 
 
505 aa  269  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  38.55 
 
 
512 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  39.29 
 
 
510 aa  269  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  36.67 
 
 
493 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  37.8 
 
 
503 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2206  Leucyl aminopeptidase  42.86 
 
 
501 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00206778  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  43.52 
 
 
524 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  42.92 
 
 
545 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  38.13 
 
 
503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0328  leucyl aminopeptidase  41.98 
 
 
530 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0360646  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2878  leucyl aminopeptidase  38.37 
 
 
497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  36.73 
 
 
493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  37.72 
 
 
503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  34.97 
 
 
495 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  45.97 
 
 
485 aa  266  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  39.39 
 
 
510 aa  266  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0069  leucyl aminopeptidase  35.79 
 
 
496 aa  266  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2018  leucyl aminopeptidase  36.13 
 
 
490 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  37.91 
 
 
503 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  35.11 
 
 
512 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  37.69 
 
 
503 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
495 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  37.41 
 
 
502 aa  263  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  37.69 
 
 
503 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  40.72 
 
 
503 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  38.14 
 
 
497 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2727  leucyl aminopeptidase  36.58 
 
 
491 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  44.67 
 
 
485 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3321  leucyl aminopeptidase  38.68 
 
 
513 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.177595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  40.04 
 
 
502 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  39.96 
 
 
497 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0561  leucyl aminopeptidase  39.84 
 
 
490 aa  260  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  37.47 
 
 
503 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3310  leucyl aminopeptidase  38.95 
 
 
513 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  37.47 
 
 
503 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  38.14 
 
 
497 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3372  leucyl aminopeptidase  38.95 
 
 
513 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.183674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  37.36 
 
 
508 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  38.36 
 
 
497 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  38.16 
 
 
503 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  38.16 
 
 
503 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  38.16 
 
 
503 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4247  Leucyl aminopeptidase  41.3 
 
 
518 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  40.98 
 
 
499 aa  259  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05571  leucyl aminopeptidase  41.37 
 
 
506 aa  259  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1518  Leucyl aminopeptidase  40.51 
 
 
505 aa  259  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  37.94 
 
 
503 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  37.94 
 
 
503 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>