24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0757 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  386  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  42.26 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  32.57 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  36.36 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  35.54 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  34.44 
 
 		 130 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  39.13 
 
 		 122 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3839  hypothetical protein  31.5 
 
 		 131 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315834  normal  0.233166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  42.65 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  36.71 
 
 		 119 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  37.97 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  35.71 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.61 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  33.61 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  51.11 
 
 		 137 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  32.77 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  38.67 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  32.98 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  33.85 
 
 		 133 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.85 
 
 		 133 aa  41.6  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.22 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  46.55 
 
 		 126 aa  41.2  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  41.54 
 
 		 134 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>