More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1170 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  45.81 
 
 		 807 aa  636    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0371  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.87 
 
 		 766 aa  683    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1170  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 793 aa  1596    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  42.36 
 
 		 802 aa  632  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  43.88 
 
 		 809 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  44.35 
 
 		 812 aa  630  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  44.22 
 
 		 796 aa  625  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  41.81 
 
 		 818 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  44.25 
 
 		 788 aa  621  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  41.39 
 
 		 901 aa  617  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  42.4 
 
 		 825 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  44.04 
 
 		 816 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  43.14 
 
 		 832 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  42.82 
 
 		 809 aa  610  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  41.91 
 
 		 853 aa  612  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  43.23 
 
 		 809 aa  610  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  42.63 
 
 		 816 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  42.86 
 
 		 827 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  42.52 
 
 		 807 aa  607  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  43.73 
 
 		 808 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  42.35 
 
 		 836 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  42.26 
 
 		 812 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  42.66 
 
 		 814 aa  599  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  41.27 
 
 		 839 aa  600  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  42.7 
 
 		 809 aa  601  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  43.24 
 
 		 820 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  42.35 
 
 		 836 aa  601  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  43.11 
 
 		 839 aa  598  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  43.11 
 
 		 839 aa  598  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  42.56 
 
 		 809 aa  595  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1660  DNA gyrase, A subunit  44.19 
 
 		 804 aa  595  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00811487  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1733  DNA gyrase, A subunit  44.44 
 
 		 804 aa  595  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.28256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  42.87 
 
 		 814 aa  594  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  42.91 
 
 		 819 aa  595  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  43.12 
 
 		 811 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  41.39 
 
 		 857 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  41.53 
 
 		 830 aa  590  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  40.76 
 
 		 816 aa  592  1e-167  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  41.03 
 
 		 828 aa  592  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  40.94 
 
 		 852 aa  592  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5446  DNA gyrase, A subunit  41.36 
 
 		 859 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  42.82 
 
 		 823 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  42.14 
 
 		 828 aa  587  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  41.07 
 
 		 821 aa  587  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  43.18 
 
 		 823 aa  587  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  42.2 
 
 		 818 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  40.48 
 
 		 823 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  41.66 
 
 		 815 aa  584  1.0000000000000001e-165  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  40.2 
 
 		 823 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  40.6 
 
 		 823 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  39.9 
 
 		 834 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  41.6 
 
 		 835 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0894  DNA gyrase, A subunit  40.4 
 
 		 845 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2163  DNA gyrase, A subunit  41.88 
 
 		 869 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.612528 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1016  DNA gyrase, A subunit  40.4 
 
 		 845 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  40.48 
 
 		 823 aa  580  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  40.48 
 
 		 823 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  40.48 
 
 		 823 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  40.48 
 
 		 823 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0088  DNA gyrase subunit A  42.17 
 
 		 844 aa  580  1e-164  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  41.12 
 
 		 830 aa  579  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  41.92 
 
 		 827 aa  579  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  40.48 
 
 		 823 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  40.48 
 
 		 823 aa  581  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  40.35 
 
 		 823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  43.65 
 
 		 824 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  41.16 
 
 		 843 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  41.47 
 
 		 811 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  41.84 
 
 		 806 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  41.4 
 
 		 838 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  41.03 
 
 		 828 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  40.76 
 
 		 857 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  41.2 
 
 		 879 aa  574  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  41.54 
 
 		 949 aa  570  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1744  DNA gyrase subunit A  38.22 
 
 		 943 aa  571  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4501  DNA gyrase, A subunit  41.09 
 
 		 907 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  39.98 
 
 		 865 aa  571  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1072  DNA gyrase subunit A  38.97 
 
 		 915 aa  571  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0323  DNA gyrase, A subunit  42.86 
 
 		 846 aa  571  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  41.43 
 
 		 838 aa  569  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2730  DNA gyrase, A subunit  40.38 
 
 		 819 aa  568  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  38.9 
 
 		 882 aa  568  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  40.49 
 
 		 835 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  39.41 
 
 		 829 aa  566  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  40.39 
 
 		 899 aa  568  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1021  DNA gyrase, A subunit  38.17 
 
 		 856 aa  567  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0962038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  39.29 
 
 		 809 aa  566  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0096  DNA gyrase, A subunit  43.11 
 
 		 827 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180112  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  40.32 
 
 		 893 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  40.82 
 
 		 855 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0638  DNA gyrase, A subunit  39.28 
 
 		 848 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00668409  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0994  DNA gyrase, A subunit  39.92 
 
 		 827 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1142  DNA gyrase subunit A  40.36 
 
 		 858 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4482  DNA gyrase, A subunit  40.73 
 
 		 906 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  40.12 
 
 		 826 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  38.33 
 
 		 865 aa  565  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0413  DNA gyrase subunit A  40.6 
 
 		 824 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0903108  decreased coverage  0.000217687 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  40.05 
 
 		 840 aa  564  1.0000000000000001e-159  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  41.07 
 
 		 827 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4493  DNA gyrase, A subunit  41.31 
 
 		 891 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0318161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>