25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2763 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  41.79 
 
 		 268 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  50 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  40.5 
 
 		 291 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  43.75 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  48.1 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  47.18 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  40.31 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  38.24 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  37.37 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  41.61 
 
 		 596 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  44.37 
 
 		 233 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  38.61 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  38.61 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  39.07 
 
 		 151 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  39.31 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  43.44 
 
 		 234 aa  96.3  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  37.24 
 
 		 507 aa  90.1  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  39.47 
 
 		 127 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  49.3 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  26.58 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  31.01 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  40.24 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2164  hypothetical protein  33.83 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.107733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2319  hypothetical protein  33.83 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>