35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1443 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  90.23 
 
 		 225 aa  407  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  85.12 
 
 		 225 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  53.81 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  41.04 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  39.04 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  36.32 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  37.76 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  37.82 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  37.11 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  36.46 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  35.98 
 
 		 203 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  37.73 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  33.98 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  36.17 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  33.68 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  32.21 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  36.81 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  36.26 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  34 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  34.04 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  35.56 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  31.2 
 
 		 243 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  31.2 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  44.29 
 
 		 72 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  29.48 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  26.4 
 
 		 272 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  30.97 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  27.88 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  25.39 
 
 		 274 aa  48.5  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  26.32 
 
 		 360 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  24.73 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  24.39 
 
 		 311 aa  41.6  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>