155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2223 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2223  propanediol utilization protein (pduK)  100 
 
 		 153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2269  propanediol utilization protein  100 
 
 		 153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.41069  normal  0.047753 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2382  propanediol utilization protein  100 
 
 		 153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2169  polyhedral body protein  98.04 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2216  polyhedral body protein  97.39 
 
 		 153 aa  275  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2287  propanediol utilization protein PduK  67.76 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0204  microcompartments protein  50 
 
 		 288 aa  97.1  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1742  microcompartments protein  28.96 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1948  microcompartments protein  33.7 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  43.9 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  41.77 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  41.25 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  36.05 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2087  microcompartments protein  34.78 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  36.05 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0894  ethanolamine utilization protein  41.77 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  36.05 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  36.05 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  34.88 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1608  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  37.8 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  36.05 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  36.05 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  39.24 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  36.05 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  34.88 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  34.88 
 
 		 114 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  34.88 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  36.05 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  42.86 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3284  carbon dioxide concentrating mechanism protein (PduA related)-like  39.24 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1181  microcompartments protein  35 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  34.88 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0758  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  38.46 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.531252  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  34.88 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  34.88 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  34.88 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  39.51 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  39.51 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  39.51 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  39.51 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  39.51 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  39.51 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  39.51 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  39.51 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  39.51 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  39.74 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  39.51 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  39.74 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  39.74 
 
 		 97 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4908  microcompartments protein  39.24 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3286  microcompartments protein  39.24 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4893  microcompartments protein  40.38 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08151  hypothetical protein  37.33 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  34.18 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0812  microcompartments protein  38.96 
 
 		 270 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0785  microcompartments protein  38.96 
 
 		 270 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  38.95 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1293  microcompartments protein  43.21 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  41.46 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  35.8 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  43.04 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2748  microcompartments protein  38.96 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2056  microcompartments protein  39.76 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4467  microcompartments protein  38.96 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3846  microcompartments protein  35.06 
 
 		 258 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0700872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1038  microcompartments protein  44.16 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4097  microcompartments protein  41.77 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  37.63 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2644  carboxysome structural peptide CsoS1B  38.37 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4338  carboxysome structural polypeptide  38.37 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  36.59 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  41.77 
 
 		 98 aa  48.5  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  40.26 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  37.66 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1860  microcompartments protein  38.96 
 
 		 262 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.864195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2386  microcompartments protein  32.93 
 
 		 111 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  37.66 
 
 		 100 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3267  microcompartments protein  42.35 
 
 		 222 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.820154  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  37.66 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  37.66 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  37.66 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1980  carboxysome structural peptide CsoS1B  37.21 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0126  microcompartments protein  37.66 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  42.31 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0125  microcompartments protein  37.66 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0124  microcompartments protein  37.66 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  37.66 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3196  carboxysome structural peptide CsoS1B  36.36 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  37.66 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  37.66 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0865  microcompartments protein  36.36 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4339  carboxysome structural peptide CsoS1B  37.21 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  36.36 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2286  propanediol utilization protein PduJ  45.45 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1383  microcompartments protein  36.36 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0866  microcompartments protein  36.36 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.457489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3195  carboxysome structural peptide CsoS1B  36.36 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0908  microcompartments protein  43.59 
 
 		 92 aa  47.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0864  microcompartments protein  36.36 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.465845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3197  carboxysome shell protein, CsoS1C  36.36 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>