116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1742 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1742  microcompartments protein  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2169  polyhedral body protein  28.42 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2223  propanediol utilization protein (pduK)  28.96 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2269  propanediol utilization protein  28.96 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.41069  normal  0.047753 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2382  propanediol utilization protein  28.96 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2216  polyhedral body protein  27.87 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1948  microcompartments protein  33.98 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2287  propanediol utilization protein PduK  23.12 
 
 		 140 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0204  microcompartments protein  35.63 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1359  microcompartments protein  41.24 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  41.98 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06101  carboxysome structural protein CsoS1  41.03 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.33467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1181  microcompartments protein  40.79 
 
 		 100 aa  52  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1885  carboxysome shell peptide, CsoS1  41.03 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  43.59 
 
 		 97 aa  51.2  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  43.59 
 
 		 96 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  43.59 
 
 		 102 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05581  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  42.31 
 
 		 103 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  42.31 
 
 		 103 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  42.31 
 
 		 103 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  42.31 
 
 		 103 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  42.31 
 
 		 103 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  42.31 
 
 		 103 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  42.31 
 
 		 103 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  42.31 
 
 		 103 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  42.31 
 
 		 103 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  41.25 
 
 		 113 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  42.31 
 
 		 103 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1608  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  41.03 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0758  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  41.03 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.531252  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  44.16 
 
 		 98 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4338  carboxysome structural polypeptide  44.16 
 
 		 99 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0894  ethanolamine utilization protein  40.32 
 
 		 254 aa  47.8  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3267  microcompartments protein  37.17 
 
 		 222 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.820154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  37.18 
 
 		 96 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4893  microcompartments protein  33.33 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4908  microcompartments protein  47.37 
 
 		 98 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3270  ethanolamine utilization protein eutM precursor  45.28 
 
 		 92 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  35.56 
 
 		 99 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  42.86 
 
 		 98 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1186  microcompartments protein  33.75 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0126  microcompartments protein  42.86 
 
 		 107 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  41.56 
 
 		 110 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  42.86 
 
 		 98 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  42.86 
 
 		 112 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  42.86 
 
 		 98 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  42.86 
 
 		 112 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  42.86 
 
 		 100 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1355  microcompartments protein  39.51 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.431976  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0124  microcompartments protein  42.86 
 
 		 103 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0125  microcompartments protein  42.86 
 
 		 103 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2644  carboxysome structural peptide CsoS1B  42.86 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  42.86 
 
 		 101 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  42.86 
 
 		 99 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1980  carboxysome structural peptide CsoS1B  41.56 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  31.86 
 
 		 276 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08151  hypothetical protein  41.89 
 
 		 91 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3286  microcompartments protein  44.83 
 
 		 99 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0205  microcompartments protein  45.1 
 
 		 96 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  38.96 
 
 		 96 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1383  microcompartments protein  41.56 
 
 		 98 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  41.56 
 
 		 98 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4339  carboxysome structural peptide CsoS1B  41.56 
 
 		 115 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0864  microcompartments protein  41.56 
 
 		 99 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.465845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0865  microcompartments protein  41.56 
 
 		 97 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3196  carboxysome structural peptide CsoS1B  41.56 
 
 		 97 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3197  carboxysome shell protein, CsoS1C  41.56 
 
 		 99 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1414  microcompartments protein  49.02 
 
 		 98 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2222  propanediol utilization protein PduJ  47.06 
 
 		 91 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.68551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2268  propanediol utilization protein PduJ  47.06 
 
 		 91 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.0436831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2215  propanediol utilization protein PduJ  47.06 
 
 		 91 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2168  propanediol utilization protein PduJ  47.06 
 
 		 91 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2381  propanediol utilization protein PduJ  47.06 
 
 		 91 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  43.4 
 
 		 104 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2286  propanediol utilization protein PduJ  45.1 
 
 		 91 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0866  microcompartments protein  41.56 
 
 		 104 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.457489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3195  carboxysome structural peptide CsoS1B  41.56 
 
 		 112 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0075  microcompartments protein  45.28 
 
 		 99 aa  45.1  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3846  microcompartments protein  40.35 
 
 		 258 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0700872 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0896  ethanolamine utilization protein EutM  45.1 
 
 		 96 aa  44.7  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  47.06 
 
 		 98 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  37.18 
 
 		 93 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0812  microcompartments protein  37.93 
 
 		 270 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0785  microcompartments protein  37.93 
 
 		 270 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2748  microcompartments protein  36.21 
 
 		 271 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0357  microcompartments protein  47.06 
 
 		 96 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3284  carbon dioxide concentrating mechanism protein (PduA related)-like  41.38 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1233  microcompartments protein  42.31 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  45.1 
 
 		 105 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0507  propanediol utilization  41.18 
 
 		 100 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.543928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2648  major carboxysome shell protein 1A (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  40.54 
 
 		 98 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1415  microcompartments protein  33.75 
 
 		 102 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1430  microcompartments protein  45.1 
 
 		 94 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0073  microcompartments protein  39.24 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  41.38 
 
 		 100 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  45.1 
 
 		 96 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4890  microcompartments protein  45.1 
 
 		 95 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2345  microcompartments protein  43.14 
 
 		 106 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000506972  hitchhiker  0.00332823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1299  microcompartments protein  36.08 
 
 		 95 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>