More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1177 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1177  U32 family peptidase  100 
 
 
307 aa  637    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1704  peptidase U32  85.67 
 
 
307 aa  559  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.77718  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1670  peptidase U32  85.67 
 
 
307 aa  559  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3095  peptidase U32  59.67 
 
 
309 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.134214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4278  U32 family peptidase  59.02 
 
 
309 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4126  U32 family peptidase  59.02 
 
 
309 aa  381  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.301861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4462  peptidase, U32 family  58.69 
 
 
309 aa  381  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4502  peptidase, U32 family  58.36 
 
 
309 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0734  peptidase, U32 family  58.03 
 
 
309 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118856  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4229  peptidase U32  58.03 
 
 
309 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.093323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4464  U32 family peptidase  58.03 
 
 
309 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.380474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4115  U32 family peptidase  58.36 
 
 
309 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2484  peptidase U32  58.69 
 
 
309 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.489664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4515  peptidase, U32 family  58.03 
 
 
309 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000415029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0968  peptidase U32  55.41 
 
 
309 aa  358  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4610  U32 family peptidase  59.57 
 
 
282 aa  358  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0570237  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  34.77 
 
 
407 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0724  protease  35.45 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  35.71 
 
 
409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  35.71 
 
 
409 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  35.41 
 
 
419 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  35.99 
 
 
411 aa  182  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  35.5 
 
 
408 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  34.74 
 
 
411 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  35.1 
 
 
404 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  35.71 
 
 
412 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  33.77 
 
 
406 aa  175  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  35.06 
 
 
405 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  34.95 
 
 
420 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  35.37 
 
 
406 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  34.95 
 
 
439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  34.64 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2252  collagenase-like protease  33.67 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  31.7 
 
 
435 aa  169  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  33.55 
 
 
427 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  31.7 
 
 
430 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  32.13 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  32.89 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  34.09 
 
 
403 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  33.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  33.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  33.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  33.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  34.05 
 
 
426 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  33.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  33.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  33.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  33.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  33.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  31.05 
 
 
428 aa  160  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  32.97 
 
 
426 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0741  hypothetical protein  29.97 
 
 
303 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  32.79 
 
 
412 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  32.46 
 
 
439 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  31.75 
 
 
422 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  31.39 
 
 
422 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  33.22 
 
 
404 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  32.78 
 
 
406 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  32.57 
 
 
404 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  32.03 
 
 
413 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  30.69 
 
 
422 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  30.82 
 
 
422 aa  145  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  30.82 
 
 
422 aa  145  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  30.26 
 
 
447 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  28.99 
 
 
428 aa  143  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  31.02 
 
 
783 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  29.04 
 
 
410 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  29.38 
 
 
453 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  31.15 
 
 
440 aa  135  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0576  peptidase U32  30.09 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1050  putative protease  32.14 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.861242  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  29.11 
 
 
458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  28.72 
 
 
435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  27.83 
 
 
453 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  29.43 
 
 
434 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  28.77 
 
 
767 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  30.69 
 
 
862 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  29.18 
 
 
471 aa  132  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  30.88 
 
 
422 aa  132  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  28.74 
 
 
455 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  28.71 
 
 
548 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  30.67 
 
 
411 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  28.36 
 
 
455 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  28.36 
 
 
455 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  28.36 
 
 
455 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  29.28 
 
 
454 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  29.28 
 
 
454 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  29.28 
 
 
454 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  29.2 
 
 
440 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  29.19 
 
 
455 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  28.07 
 
 
455 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  27.86 
 
 
454 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  28.2 
 
 
455 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  27.62 
 
 
471 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  27.68 
 
 
469 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  28.45 
 
 
454 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  28.93 
 
 
413 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0724  U32 family peptidase  29.51 
 
 
417 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000627659  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0801  U32 family peptidase  29.84 
 
 
417 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  30.82 
 
 
417 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>