67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1136 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  48.44 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0606  hypothetical protein  48.44 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.306362  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  57.14 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0619  hypothetical protein  43.75 
 
 
66 aa  50.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  48.33 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  49.02 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  49.12 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  42.86 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  44.26 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0644  hypothetical protein  52 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.624559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  44.26 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  47.06 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  37.7 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  47.06 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  47.06 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  47.06 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  47.06 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  41.07 
 
 
57 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  41.07 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1630  CsbD family protein  56.82 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  40.74 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  43.86 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  37.04 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  42.59 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  45.1 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  38.18 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  38.1 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1573  hypothetical protein  49.02 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  33.9 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  38.18 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0858  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.228547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1081  hypothetical protein  45.1 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1063  hypothetical protein  44.83 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4306299999999999e-37 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1716  CsbD family protein  43.86 
 
 
60 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000823848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0923  hypothetical protein  44.83 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0908  hypothetical protein  44.83 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000630947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0891  hypothetical protein  44.83 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0987  hypothetical protein  44.83 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1683  CsbD family protein  43.86 
 
 
60 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000685848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0898  CsbD family protein  44.83 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  33.93 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  34.55 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  36.36 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  36.36 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  30.16 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4275  hypothetical protein  43.1 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.186027  hitchhiker  0.00765973 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1154  hypothetical protein  44.83 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  50 
 
 
59 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  31.75 
 
 
67 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  29.23 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  40 
 
 
55 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  30.16 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  34.62 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  44.44 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  34.62 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  30.16 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  29.09 
 
 
60 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0841  CsbD family protein  42.11 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257434  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1963  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.435104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0857  CsbD family protein  42.11 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00154201  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  30.91 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  31.25 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  39.62 
 
 
64 aa  40  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0494  hypothetical protein  38.71 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.109634  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  30.91 
 
 
56 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  40.38 
 
 
56 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>