77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3144 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3144  cation antiporter  100 
 
 		 163 aa  317  7e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1797  cation antiporter  61.76 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1206  cation antiporter  43.03 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0203204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30380  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  35.98 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.87 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.58 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  31.58 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.85 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.57 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.78 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.14 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  37.65 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.95 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.52 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  34.34 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.34 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  34.26 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  34.65 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.2 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.94 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  32.63 
 
 		 219 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.1 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  28.12 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.57 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  35.29 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  29.47 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.25 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.72 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.03 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  29.63 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.7 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.92 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  28.26 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.84 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  35.94 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.82 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  34.78 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.12 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.12 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.28 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  23.14 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.3 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  29.79 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  30.77 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.43 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.11 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  25.45 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.35 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.14 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.77 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  38.89 
 
 		 129 aa  44.3  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.17 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.85 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.97 
 
 		 178 aa  43.9  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.66 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  26.95 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  33.33 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3454  cation antiporter  37.5 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.66 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  31.25 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  24.04 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.14 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  23.19 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  30.67 
 
 		 180 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.77 
 
 		 162 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.17 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.17 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.3 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.81 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  34.62 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  29.17 
 
 		 198 aa  40.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.93 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>