More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2139 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 116 aa  226  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  61.21 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  62.73 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  63.25 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  63.25 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  61.26 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  57.38 
 
 		 120 aa  130  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  63.3 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  60.75 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  60.91 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  59.29 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  54.24 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 125 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  59.13 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  60.71 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  58.33 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  62 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  62 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  56.64 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  56.64 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 122 aa  123  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  58.04 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  60 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  61.62 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  54.4 
 
 		 125 aa  120  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  61.76 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 		 120 aa  120  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 123 aa  120  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 		 114 aa  119  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  55.05 
 
 		 117 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  55.86 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  57.39 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  57.28 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  56.52 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  51.67 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  60.36 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  54.46 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  54.39 
 
 		 116 aa  116  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  51.3 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  56.6 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  50.83 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  54.46 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  48.76 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  58.59 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  52.21 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1356  ribosomal protein L18  64.21 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  56.6 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  47.5 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  47.9 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  52.14 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>