More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1625 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 
480 aa  914    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.137043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  38.72 
 
 
484 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.18 
 
 
487 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.72 
 
 
487 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.02 
 
 
484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.45 
 
 
484 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.36 
 
 
484 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.21 
 
 
476 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.55 
 
 
492 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.34 
 
 
476 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  36.25 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  36.79 
 
 
476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  36.25 
 
 
482 aa  254  3e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1863  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.15 
 
 
513 aa  251  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.27 
 
 
511 aa  249  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.9 
 
 
496 aa  249  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.41 
 
 
511 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.714815  normal  0.834911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2581  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.05 
 
 
516 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0861426  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1531  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.19 
 
 
482 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0854  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.67 
 
 
511 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.23 
 
 
511 aa  247  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  37.05 
 
 
478 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  37.36 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  36.49 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.07 
 
 
511 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  35.85 
 
 
479 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.52 
 
 
483 aa  244  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  38.74 
 
 
476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.56 
 
 
505 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1267  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.29 
 
 
516 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  36.78 
 
 
478 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.29 
 
 
516 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  35.63 
 
 
480 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  36.78 
 
 
478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04321  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.68 
 
 
523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1767  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.12 
 
 
520 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.506609  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0971  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.31 
 
 
511 aa  240  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162781  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1766  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.68 
 
 
523 aa  239  6.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0127704  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.28 
 
 
479 aa  239  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  33.71 
 
 
481 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  36.09 
 
 
487 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1415  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  33.79 
 
 
521 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  36.27 
 
 
479 aa  239  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.07 
 
 
518 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2025  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  33.41 
 
 
514 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  35.8 
 
 
489 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  36.07 
 
 
489 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.38 
 
 
517 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.38 
 
 
517 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.76 
 
 
483 aa  236  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  37.1 
 
 
481 aa  236  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  36.08 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.04 
 
 
489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  34.49 
 
 
485 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  34.49 
 
 
485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.49 
 
 
498 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  37.24 
 
 
481 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  34.49 
 
 
485 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  34.49 
 
 
485 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  34.49 
 
 
485 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.36 
 
 
506 aa  233  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.50446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.69 
 
 
485 aa  232  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  34.69 
 
 
485 aa  232  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  34.69 
 
 
485 aa  232  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  35.25 
 
 
489 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  34.69 
 
 
485 aa  232  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.62 
 
 
489 aa  232  9e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  34.69 
 
 
485 aa  232  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  34.49 
 
 
485 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.56 
 
 
477 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0644  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.81 
 
 
513 aa  232  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.340607  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0714  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.18 
 
 
503 aa  232  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.760446  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  35.25 
 
 
489 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1476  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.84 
 
 
525 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.217094  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.65 
 
 
476 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  35.17 
 
 
479 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  36.65 
 
 
425 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  36.65 
 
 
425 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  35.26 
 
 
478 aa  230  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.34 
 
 
482 aa  230  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1107  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.04 
 
 
511 aa  230  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  33.74 
 
 
485 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04971  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.81 
 
 
506 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  37.02 
 
 
478 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5167  NADH dehydrogenase subunit N  34.6 
 
 
497 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  36.06 
 
 
486 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  36 
 
 
489 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2998  NADH dehydrogenase subunit N  37.97 
 
 
481 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  34.49 
 
 
485 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  35.66 
 
 
486 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2153  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.23 
 
 
520 aa  227  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.547893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.46 
 
 
482 aa  227  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  34.66 
 
 
478 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  34.66 
 
 
478 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.4 
 
 
481 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.55 
 
 
506 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  33.68 
 
 
478 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  36.53 
 
 
485 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04591  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.55 
 
 
506 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  35.8 
 
 
489 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>