162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0534 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0534  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
123 aa  248  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2731  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  54.87 
 
 
133 aa  140  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20873  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.13 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  43.97 
 
 
127 aa  90.1  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3222  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.26 
 
 
141 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0490977  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.07 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  35.83 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.83 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.83 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
129 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  38.39 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.97 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.7 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.78 
 
 
374 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.91 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  29.73 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.2 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.57 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.51 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  30.97 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.82 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.97 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.51 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42200  Rieske type ferredoxin  32.73 
 
 
122 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.42204  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  30 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3247  Rieske (2Fe-2S) region  28.32 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206921  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  30.77 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.43 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  31.13 
 
 
291 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  29.82 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  28.97 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.83 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.2 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.37 
 
 
107 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  27.68 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  29.57 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.51 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2423  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.67 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2471  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.67 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  29.09 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.55 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6323  Rieske (2Fe-2S) region  27.03 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.93 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.55 
 
 
112 aa  52  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  26.5 
 
 
110 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.59 
 
 
289 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  28.32 
 
 
315 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  27.43 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0173  Rieske (2Fe-2S) region  29.2 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  28.07 
 
 
270 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.66 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4231  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.2 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7057  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.2 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250016  normal  0.403256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  31.9 
 
 
289 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.63 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 
518 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  31.9 
 
 
656 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0844  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.22 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3350  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.22 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.73 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.45 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3462  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.52 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.93 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0591  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  28.45 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3866  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.26 
 
 
108 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.83 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18750  phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  33.33 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3052  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.35 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279296  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2315  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.49 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.791717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.86 
 
 
105 aa  47.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.97 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  24.78 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.78 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  25.41 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.06 
 
 
296 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.91 
 
 
286 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.84 
 
 
526 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  25 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  25 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.57 
 
 
506 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  29.29 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  25 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.28 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  25.41 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  26.17 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.82 
 
 
649 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  28.7 
 
 
349 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3956  Rieske (2Fe-2S) protein  28.71 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1331  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  24.58 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.13 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.47 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.53 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  23.39 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1503  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  29.2 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3274  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.35 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.59 
 
 
285 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0321  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  29.2 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0597  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  29.2 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0893389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>