178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3222 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3222  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  291  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0490977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  43.97 
 
 
129 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.97 
 
 
129 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.97 
 
 
129 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.55 
 
 
129 aa  103  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.64 
 
 
129 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.34 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2731  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  43.52 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20873  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  41.51 
 
 
127 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0534  Rieske (2Fe-2S) region  39.13 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.02 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.17 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.77 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.77 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.83 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18750  phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.82 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.19 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  31.53 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.17 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.03 
 
 
111 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.94 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  32.14 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  31.3 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.73 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.92 
 
 
289 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.12 
 
 
604 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  27.93 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3866  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.95 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
158 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  30.85 
 
 
102 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  25.78 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30.28 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  25.78 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.74 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  32.97 
 
 
656 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4524  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30.56 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.85 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.71 
 
 
374 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0720  Rieske (2Fe-2S) region  26.72 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.457021  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  29.63 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42200  Rieske type ferredoxin  27.52 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.42204  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.45 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  30.39 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2955  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.41 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.97 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  28 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0591  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  27.45 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.45 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  28.83 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.27 
 
 
105 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.22 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2894  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.91 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4109  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30.85 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.78 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  27.59 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.59 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  27.59 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  27.59 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  27.59 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  27.59 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  27.59 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  27.59 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  24.53 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1628  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.21 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3247  Rieske (2Fe-2S) region  29.07 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206921  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1701  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  25.37 
 
 
132 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104071  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0795  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.42 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  30.23 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  25.93 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5893  nitrite reductase small subunit  28.04 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.93 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383279  normal  0.78464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
96 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.85 
 
 
294 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.03 
 
 
105 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.63 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0985  Rieske (2Fe-2S) region  29.89 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.750027  hitchhiker  0.00017635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3052  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.61 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.2 
 
 
518 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  23.36 
 
 
291 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.29 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3350  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.76 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.83 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.68 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00226382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0844  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.76 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.89 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  32.61 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1780  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  26.47 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.307476  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3441  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.97 
 
 
599 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2068  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.38 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360129  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0814  benzene 1,2-dioxygenase, ferredoxin protein  28.83 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2879  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.13 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.388175  normal  0.0551812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4231  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6175  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.92 
 
 
593 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659991  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>