More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0249 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  494  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  61.85 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  36.53 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  35.77 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  31.52 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  34.12 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  33.04 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  29.77 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  26.92 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  30.11 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.27 
 
 
2798 aa  73.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  31.11 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  31.11 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  33.51 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  31.11 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  33.03 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  33.86 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  30.1 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  27.65 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  27.44 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  32.52 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  36.53 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  32.09 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  30.27 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  29.96 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  31.4 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  32.52 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  31.8 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  27.51 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  29.38 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  26.19 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  26.47 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  30.26 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  34.2 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  29 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  30.59 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  33.18 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  30.83 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.75 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  31.23 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  30.68 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  26.75 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  26.75 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  35.25 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  39.66 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.43 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  31.82 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  35.25 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  28.95 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  30.7 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  25.73 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  25.73 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  24.28 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.35 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  30.1 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  24.45 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  28.33 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  25.77 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  28.33 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  24.45 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  29.2 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  31.78 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  30.86 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  27.1 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  24.45 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  34.52 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  27.53 
 
 
345 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  27.68 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  28.36 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  30.21 
 
 
277 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  32.23 
 
 
251 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  27.68 
 
 
266 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  31.71 
 
 
303 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  27.07 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  27.07 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  27.63 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  27.63 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  31.66 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  26.54 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.01 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  28.31 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  34.1 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  26.51 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  37.28 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  25.13 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.17 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  28.38 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  36.22 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  32.17 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  32.48 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  29.02 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  24.42 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  27.61 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.24 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.14 
 
 
307 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  26.34 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0366  hypothetical protein  30.04 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  25.78 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>