More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0245 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
260 aa  521  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 
259 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  54.4 
 
 
271 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.44 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
262 aa  265  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  51.75 
 
 
261 aa  259  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1330  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.28 
 
 
275 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.71221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  49.21 
 
 
257 aa  248  8e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5727  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0364977  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1475  enoyl-CoA hydratase  51.15 
 
 
265 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
259 aa  238  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2913  enoyl-CoA hydratase  48.31 
 
 
270 aa  231  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.944224  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2770  enoyl-CoA hydratase  53.44 
 
 
263 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1160  enoyl-CoA hydratase  53.44 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2157  enoyl-CoA hydratase  45.68 
 
 
257 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 
259 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6416  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.69 
 
 
254 aa  222  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.15 
 
 
252 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4649  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
274 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal  0.29144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5112  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
274 aa  218  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.649242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1773  enoyl-CoA hydratase  52.92 
 
 
263 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5190  enoyl-CoA hydratase  48.81 
 
 
274 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00117238  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.19 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.351238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  38.95 
 
 
266 aa  194  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
274 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
269 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.2 
 
 
260 aa  154  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.2 
 
 
260 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
260 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
260 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
260 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
265 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
260 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
265 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
267 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 
262 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
260 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
259 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
273 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.89 
 
 
259 aa  142  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.71 
 
 
257 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.43 
 
 
258 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
260 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.83 
 
 
659 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
266 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
265 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
254 aa  138  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
265 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.6 
 
 
663 aa  138  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
261 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
260 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.42 
 
 
260 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
260 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
260 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
260 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 
260 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.31 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
271 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.79 
 
 
654 aa  136  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.54 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.93 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
258 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
257 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.31 
 
 
260 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2124  naphthoate synthase  33.33 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000363984  normal  0.0450036 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.27 
 
 
260 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
258 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
265 aa  131  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
257 aa  131  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  33.21 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.55 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>