169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1145 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  100 
 
 
317 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2875  glucokinase  88.96 
 
 
317 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1521  glucokinase  88.96 
 
 
317 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540329  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1655  glucokinase  58.1 
 
 
323 aa  325  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692782  hitchhiker  0.0000702574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1943  glucokinase  48.9 
 
 
315 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  29.36 
 
 
351 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  34.46 
 
 
335 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  35.24 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  31.38 
 
 
342 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2680  glucokinase  37.3 
 
 
307 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  34.67 
 
 
334 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  34.12 
 
 
338 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  31.58 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  32.81 
 
 
327 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  32.91 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  32.35 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  32.8 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  32.91 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  32.91 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  30.97 
 
 
321 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  30.97 
 
 
321 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  30.97 
 
 
321 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  30.97 
 
 
321 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  30.97 
 
 
321 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  28.45 
 
 
353 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  31.31 
 
 
322 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  30.97 
 
 
321 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  30.97 
 
 
321 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  30.97 
 
 
321 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  33.54 
 
 
339 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  30.97 
 
 
321 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  33.75 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  34.18 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  32.26 
 
 
346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  28.62 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  32.91 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  28.74 
 
 
349 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  28.74 
 
 
349 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  29.05 
 
 
330 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  32.38 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  30.89 
 
 
343 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  31.07 
 
 
320 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  30 
 
 
321 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  30 
 
 
321 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  30 
 
 
321 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  30 
 
 
321 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  30.65 
 
 
321 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  29.68 
 
 
321 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  31.58 
 
 
309 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  29.07 
 
 
321 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1119  glucokinase  38.38 
 
 
313 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  32.59 
 
 
319 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  33.23 
 
 
326 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  30 
 
 
321 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3425  glucokinase  30.98 
 
 
339 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0648425 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  30.25 
 
 
343 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  29.81 
 
 
324 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  32.42 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  28.43 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  32.91 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  30.06 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  35.33 
 
 
326 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  32.91 
 
 
319 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  32.8 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  31.19 
 
 
357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  37.1 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  29.35 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  31.05 
 
 
367 aa  119  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  31.75 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  32.27 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2062  glucokinase  31.89 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  28.12 
 
 
322 aa  116  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
616 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
642 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  31.6 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
642 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  26.25 
 
 
318 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  33.33 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  29.71 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  32.59 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  32.59 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  28.89 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
642 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
642 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  31.73 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  29.94 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  30.79 
 
 
642 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  30.79 
 
 
642 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  30.79 
 
 
642 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  32.65 
 
 
338 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  30.84 
 
 
342 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  29.81 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  34.46 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  28.66 
 
 
339 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  26.35 
 
 
320 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  28.44 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0309  glucokinase  34.74 
 
 
334 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  26.33 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  32.39 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>