More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2623 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  100 
 
 		 366 aa  732    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  66.21 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0627  chorismate synthase  65.4 
 
 		 365 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0254313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  66.04 
 
 		 368 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  65.67 
 
 		 361 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  65.94 
 
 		 364 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0392  chorismate synthase  69.02 
 
 		 390 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  66.49 
 
 		 371 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  65.67 
 
 		 361 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  65.85 
 
 		 366 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  66.21 
 
 		 362 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1320  chorismate synthase  69.81 
 
 		 369 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0852715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  66.48 
 
 		 357 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  65.67 
 
 		 362 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  68.03 
 
 		 366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0586  chorismate synthase  65.12 
 
 		 365 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  66.85 
 
 		 367 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  63.99 
 
 		 366 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  63.33 
 
 		 366 aa  461  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  65.47 
 
 		 361 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  62.6 
 
 		 364 aa  463  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  64.23 
 
 		 370 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0515  chorismate synthase  64.58 
 
 		 365 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  64.03 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3176  chorismate synthase  68.21 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  63.99 
 
 		 376 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0785  chorismate synthase  65.48 
 
 		 365 aa  454  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  63.43 
 
 		 365 aa  454  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  63.51 
 
 		 366 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  61 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  61.56 
 
 		 361 aa  451  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3216  chorismate synthase  67.12 
 
 		 366 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  0.10403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1873  chorismate synthase  67.66 
 
 		 371 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  61.28 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0539  chorismate synthase  63.76 
 
 		 364 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0428  chorismate synthase  63.22 
 
 		 364 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  62.33 
 
 		 366 aa  447  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  63.99 
 
 		 366 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0435  chorismate synthase  63.22 
 
 		 364 aa  448  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2990  chorismate synthase  66.58 
 
 		 366 aa  448  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  61.77 
 
 		 371 aa  447  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  63.79 
 
 		 361 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  62.05 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1015  chorismate synthase  65.85 
 
 		 364 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  60.66 
 
 		 389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  62.33 
 
 		 366 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  63.71 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  62.6 
 
 		 366 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2046  chorismate synthase  61.77 
 
 		 366 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  62.33 
 
 		 366 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  61.77 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  60.72 
 
 		 369 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  62.6 
 
 		 366 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1658  chorismate synthase  61.5 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  63.16 
 
 		 361 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  63.16 
 
 		 361 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  62.33 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  62.05 
 
 		 366 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  62.05 
 
 		 366 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  62.33 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  63.16 
 
 		 361 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  63.51 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  63.43 
 
 		 361 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2580  chorismate synthase  61.39 
 
 		 365 aa  438  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  63.51 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  63.51 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  61.22 
 
 		 366 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  63.51 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  61.22 
 
 		 366 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  63.61 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  63.51 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  61.77 
 
 		 366 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2593  chorismate synthase  63.99 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  63.51 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  63.23 
 
 		 368 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  63.43 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  63.23 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  61.77 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  61.77 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  61.77 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  61.77 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2745  chorismate synthase  61.5 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0397  chorismate synthase  59.51 
 
 		 364 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  61.77 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  61.77 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01260  chorismate synthase  60.66 
 
 		 367 aa  435  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  59.61 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  61.77 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  62.95 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  62.95 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  62.95 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  62.95 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  61.22 
 
 		 369 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0331  chorismate synthase  62.19 
 
 		 370 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.288386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  62.95 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  63.23 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  61.84 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  57.71 
 
 		 373 aa  431  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  59.56 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  63.23 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>