More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1894 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  53.02 
 
 
799 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  53.57 
 
 
748 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  51.79 
 
 
732 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  52.76 
 
 
817 aa  666    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  52.61 
 
 
732 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  55.65 
 
 
819 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  54.58 
 
 
790 aa  682    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  55.75 
 
 
823 aa  692    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  53.36 
 
 
797 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  54.73 
 
 
740 aa  688    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  51.59 
 
 
782 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  52.61 
 
 
790 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  55.12 
 
 
804 aa  674    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1894  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
754 aa  1446    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  45.3 
 
 
743 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  51.67 
 
 
835 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  52.4 
 
 
816 aa  638    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  53.63 
 
 
799 aa  667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  53.39 
 
 
741 aa  677    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  53.51 
 
 
739 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  52.62 
 
 
799 aa  663    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  54.4 
 
 
813 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  51.77 
 
 
813 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  54.3 
 
 
800 aa  670    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  44.83 
 
 
815 aa  636    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  54.2 
 
 
792 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  51.59 
 
 
782 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  54.61 
 
 
792 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  52.19 
 
 
757 aa  633  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  50.75 
 
 
730 aa  635  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  50.75 
 
 
730 aa  635  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  50.45 
 
 
1061 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  51.66 
 
 
1061 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  49.81 
 
 
872 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  52.03 
 
 
1182 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  51.26 
 
 
1061 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  46.81 
 
 
724 aa  627  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  50.45 
 
 
1063 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  50.45 
 
 
1061 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  50.45 
 
 
1063 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  53.76 
 
 
767 aa  622  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  50.39 
 
 
1040 aa  625  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  47.61 
 
 
803 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  51.41 
 
 
1021 aa  625  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  51.41 
 
 
1021 aa  625  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  49.74 
 
 
795 aa  621  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  47.77 
 
 
799 aa  621  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  53.8 
 
 
745 aa  616  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  51.39 
 
 
971 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  51.27 
 
 
1013 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  43.78 
 
 
797 aa  612  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  51.07 
 
 
946 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.28 
 
 
805 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  44.7 
 
 
793 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  44.64 
 
 
797 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  44.01 
 
 
806 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  44.84 
 
 
817 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  50.6 
 
 
937 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0031  heavy metal translocating P-type ATPase  53.29 
 
 
747 aa  601  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  43.83 
 
 
806 aa  596  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  50.92 
 
 
793 aa  598  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  43.84 
 
 
791 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  49.24 
 
 
794 aa  594  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1058  heavy metal translocating P-type ATPase  50.99 
 
 
754 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  43.52 
 
 
798 aa  595  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  45.55 
 
 
789 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  43.28 
 
 
805 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  43.28 
 
 
805 aa  592  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  44.39 
 
 
758 aa  591  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  43.28 
 
 
805 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  45.91 
 
 
821 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.84 
 
 
794 aa  588  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  43.15 
 
 
805 aa  588  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  43.15 
 
 
805 aa  588  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  43.15 
 
 
805 aa  588  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  43.61 
 
 
802 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.66 
 
 
796 aa  588  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
806 aa  588  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  43.61 
 
 
802 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  43.15 
 
 
798 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  43.15 
 
 
798 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3238  heavy metal translocating P-type ATPase  49.19 
 
 
831 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141164  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  42.74 
 
 
753 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 
827 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  41.1 
 
 
894 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  40.11 
 
 
759 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  45.01 
 
 
840 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  40.11 
 
 
759 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  45.41 
 
 
836 aa  562  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  42.67 
 
 
828 aa  556  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1051  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  49.73 
 
 
735 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  42.27 
 
 
752 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  42.56 
 
 
786 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  41.33 
 
 
750 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  43.99 
 
 
826 aa  549  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  39.87 
 
 
758 aa  552  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.98 
 
 
814 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  41.19 
 
 
818 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  45.61 
 
 
801 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  40.35 
 
 
889 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>