More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1310 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 		 380 aa  760    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  73.09 
 
 		 378 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  71.32 
 
 		 378 aa  551  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  70.16 
 
 		 382 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  68.95 
 
 		 378 aa  525  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0005  acetyl-CoA acetyltransferase  71.58 
 
 		 378 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  62.6 
 
 		 379 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  62.53 
 
 		 385 aa  464  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  61.64 
 
 		 377 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  62.27 
 
 		 378 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  60.16 
 
 		 373 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.03 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 		 388 aa  364  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 		 391 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 		 390 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  52.91 
 
 		 391 aa  358  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 392 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  51.72 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 		 390 aa  345  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 		 390 aa  345  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 390 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 390 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 390 aa  345  8e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 390 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 390 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 390 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  50.26 
 
 		 390 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 390 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  47.51 
 
 		 398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 		 390 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 		 399 aa  342  9e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  47.3 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.51 
 
 		 402 aa  339  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.77 
 
 		 398 aa  339  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  47.35 
 
 		 392 aa  336  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  46.34 
 
 		 384 aa  335  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 		 390 aa  332  6e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.61 
 
 		 387 aa  332  6e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  45.89 
 
 		 398 aa  332  7.000000000000001e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.11 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.61 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.61 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.61 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  49.22 
 
 		 398 aa  329  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  48.31 
 
 		 398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.3 
 
 		 391 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  48.31 
 
 		 398 aa  328  9e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.34 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.59 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  45.19 
 
 		 406 aa  326  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  47.4 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  46.04 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.51 
 
 		 386 aa  326  5e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 		 395 aa  325  9e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01049  acetyl-CoA acetyltransferase  47.88 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06117  acetyl-CoA acetyltransferase  47.88 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0270862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.67 
 
 		 391 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.34 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  47.79 
 
 		 398 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  44.67 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  47.59 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.2 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.68 
 
 		 391 aa  323  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  48.37 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  47.62 
 
 		 399 aa  322  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1550  acetyl-CoA acetyltransferase  47.75 
 
 		 399 aa  322  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000109593  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  46.85 
 
 		 399 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.27 
 
 		 387 aa  322  7e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  46.6 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.67 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.67 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  47.34 
 
 		 398 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.67 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  46.48 
 
 		 391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  48.83 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.41 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.53 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.83 
 
 		 387 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  46.87 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 		 406 aa  319  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.58 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.74 
 
 		 403 aa  318  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 		 390 aa  318  9e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.83 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.89 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.83 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4036  acetyl-CoA acetyltransferase  48.3 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.68 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  44.31 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.37 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  46.4 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.83 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.57 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.83 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>