231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0360 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0360  methylthioribose-1-phosphate isomerase  100 
 
 		 390 aa  778    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0665  aIF-2BI family translation initiation factor  65.12 
 
 		 362 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360605  normal  0.588664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  65.94 
 
 		 365 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0662  aIF-2BI family translation initiation factor  65.67 
 
 		 365 aa  484  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4697  methylthioribose-1-phosphate isomerase  65.08 
 
 		 374 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.293654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5307  methylthioribose-1-phosphate isomerase  67.57 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4407  methylthioribose-1-phosphate isomerase  64.29 
 
 		 374 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.791642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6183  aIF-2BI family translation initiation factor  66.49 
 
 		 365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4121  aIF-2BI family translation initiation factor  63.51 
 
 		 367 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6703  translation initiation factor, aIF-2BI family  64.59 
 
 		 364 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0451  methylthioribose-1-phosphate isomerase  65.41 
 
 		 365 aa  465  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4936  methylthioribose-1-phosphate isomerase  67.3 
 
 		 373 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0641  translation initiation factor, aIF-2BI family  66.22 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.173819 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4832  methylthioribose-1-phosphate isomerase  64.67 
 
 		 364 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5890  methylthioribose-1-phosphate isomerase  64.67 
 
 		 364 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.365892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4113  aIF-2BI family translation initiation factor  66.39 
 
 		 360 aa  455  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  64.05 
 
 		 367 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3353  translation initiation factor, aIF-2BI family  63.49 
 
 		 366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0521  methylthioribose-1-phosphate isomerase  62.97 
 
 		 367 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2247  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  63.22 
 
 		 364 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679143  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0161  methylthioribose-1-phosphate isomerase  64.77 
 
 		 367 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1886  methylthioribose-1-phosphate isomerase  62.43 
 
 		 362 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25341  methylthioribose-1-phosphate isomerase  62.5 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2386  methylthioribose-1-phosphate isomerase  63.04 
 
 		 364 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1050  methylthioribose-1-phosphate isomerase  63.04 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246086  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1913  methylthioribose-1-phosphate isomerase  60.83 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000486735  normal  0.985387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  57.34 
 
 		 362 aa  358  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1306  eIF-2B alpha/beta/delta-related protein  54.37 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0012837  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1971  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.79 
 
 		 359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.96 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.73 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  47.65 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  47.08 
 
 		 346 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  45.91 
 
 		 346 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  46.05 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.09 
 
 		 342 aa  258  9e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.36 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  45.09 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.35 
 
 		 333 aa  256  6e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.21 
 
 		 354 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.97 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  43.35 
 
 		 342 aa  252  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  45.48 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  46.83 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.92 
 
 		 347 aa  249  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.7 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.99 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.7 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.7 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.09 
 
 		 348 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.23 
 
 		 348 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  43.22 
 
 		 350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.52 
 
 		 348 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.41 
 
 		 348 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.32 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  44.15 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  44.15 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.67 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.78 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.2 
 
 		 346 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.39 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.57 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  43.77 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.57 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.57 
 
 		 351 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.57 
 
 		 351 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  44.7 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.57 
 
 		 351 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.79 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.64 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  42.69 
 
 		 321 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.54 
 
 		 350 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  44.08 
 
 		 327 aa  236  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.57 
 
 		 354 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  45.04 
 
 		 355 aa  236  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  48.18 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  42.98 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.89 
 
 		 353 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  44.64 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  44.19 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.78 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  41.57 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  43.59 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.29 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.22 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  41.86 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  44.91 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.41 
 
 		 349 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  39.89 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.94 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  41.78 
 
 		 337 aa  228  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.94 
 
 		 353 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  42.65 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  44.06 
 
 		 337 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  41.81 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.14 
 
 		 342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  39.43 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.14 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.6 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  43.6 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>