More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0154 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 265 aa  519  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  57.03 
 
 		 269 aa  285  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 		 265 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  56.98 
 
 		 267 aa  278  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  56.23 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  56.23 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  55.85 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  57.41 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  54.75 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  54.34 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  56.27 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  56.27 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  52.45 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  52.85 
 
 		 269 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  53.38 
 
 		 270 aa  264  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  53.58 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  53.21 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  53.58 
 
 		 271 aa  262  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 		 272 aa  262  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  52.45 
 
 		 271 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  51.32 
 
 		 265 aa  261  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  52.26 
 
 		 279 aa  261  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  54.34 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  51.14 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  52.26 
 
 		 268 aa  259  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 267 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 		 274 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 265 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  50.76 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  51.32 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  50.38 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 265 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  49.24 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  50.57 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 269 aa  255  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  53.21 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  51.32 
 
 		 289 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  50.38 
 
 		 267 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 269 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  51.7 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  51.88 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  49.24 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 268 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 268 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 268 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  49.43 
 
 		 268 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 		 263 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 		 277 aa  251  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  52.73 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  48.48 
 
 		 267 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2289  Dihydrodipicolinate reductase  51.89 
 
 		 276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2663  dihydrodipicolinate reductase  51.89 
 
 		 276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 271 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 275 aa  244  8e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3383  dihydrodipicolinate reductase  48.03 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000141563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  51.7 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 268 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  48.86 
 
 		 268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 		 268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  50.98 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 269 aa  241  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 273 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 273 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  46.59 
 
 		 273 aa  240  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 273 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  43.77 
 
 		 267 aa  240  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>