36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2776 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2508  hypothetical protein  82.62 
 
 		 445 aa  739    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.020002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2372  HipA domain protein  95.87 
 
 		 436 aa  825    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2776  HipA domain protein  100 
 
 		 436 aa  885    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  29.26 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  26.27 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.21 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  24.94 
 
 		 460 aa  116  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  27.32 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.21 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.21 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.03 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  26.53 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  26.5 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  22.97 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  22.67 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  23.76 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  23 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  22.8 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  21.94 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  25.06 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  25.88 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  26.25 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  20.25 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  25.1 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  25.19 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  19.7 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  22.92 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  25.88 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  24.31 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  25.3 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  22.82 
 
 		 450 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  23.68 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  23.68 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  23.68 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  23.68 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  23.68 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>