242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0602 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  100 
 
 
366 aa  739    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  58.86 
 
 
353 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  28.9 
 
 
349 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2446  acyltransferase 3  29.27 
 
 
404 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  29.58 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  26.8 
 
 
385 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3909  putative acyltransferase  30.34 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400096  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  26.92 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  26.72 
 
 
583 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  27.02 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  25.75 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  26.26 
 
 
371 aa  67  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  28.75 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  30.86 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  23.88 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  24.03 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  27.32 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  27.97 
 
 
662 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  28.57 
 
 
660 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  24.7 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  27.5 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  27.5 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  29.56 
 
 
660 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  23.45 
 
 
660 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  25.34 
 
 
396 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  22.93 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  28.62 
 
 
398 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0303  acyltransferase 3  28.31 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  21.41 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  25.47 
 
 
386 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  24.93 
 
 
634 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  28.25 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  27.87 
 
 
346 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  27.86 
 
 
679 aa  59.3  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  25.16 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  25.21 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  29.74 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  28.03 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  27.09 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  27.45 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  24.6 
 
 
710 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  24.86 
 
 
603 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  24.6 
 
 
710 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  23.78 
 
 
598 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  24.17 
 
 
660 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  24.79 
 
 
584 aa  57.8  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  22.88 
 
 
660 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1980  acyltransferase 3  26.95 
 
 
352 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357128 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  27.74 
 
 
528 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  21.75 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  27.3 
 
 
395 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4789  acyltransferase 3  28.26 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4138  acyltransferase 3  28.26 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3378  acyltransferase 3  28.26 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  25.89 
 
 
363 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  26.46 
 
 
407 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  26.46 
 
 
407 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  26.46 
 
 
407 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  24.54 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2034  acyltransferase 3  27.51 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544666  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  25.32 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  37.93 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  26.9 
 
 
478 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  32.96 
 
 
685 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  34.58 
 
 
665 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  32.35 
 
 
397 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  25 
 
 
695 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  27.84 
 
 
377 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  41.33 
 
 
695 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  26.6 
 
 
377 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  38.37 
 
 
376 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  26.87 
 
 
671 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  35.9 
 
 
690 aa  53.5  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  26.14 
 
 
667 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  30.41 
 
 
356 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  38.54 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  36.75 
 
 
393 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  27.53 
 
 
376 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  36.47 
 
 
604 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  36.47 
 
 
604 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  27.56 
 
 
404 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  37.65 
 
 
607 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  26.91 
 
 
370 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  25.07 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  25.25 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  31.43 
 
 
654 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  40.23 
 
 
374 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  38.04 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  28.02 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1965  acyltransferase family protein  23.92 
 
 
375 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  23.64 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  25.21 
 
 
379 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  27.09 
 
 
356 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  29.37 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  24.73 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  32.41 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  24.38 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  25.76 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  31.17 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  36.54 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>