64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4966 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 165 aa  339  8e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 165 aa  339  8e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  73.68 
 
 		 158 aa  244  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  71.95 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  50.69 
 
 		 152 aa  148  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  48.97 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  56.3 
 
 		 147 aa  140  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  47.14 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  47.1 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  44.94 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  43.92 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  43.97 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  40.58 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  42.22 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  35.25 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  35.54 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  34.71 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  33.88 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.58 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  34.17 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  34.92 
 
 		 125 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.75 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.19 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.19 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.19 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.19 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.19 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.19 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.19 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  33.87 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  30.71 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.88 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.11 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.21 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1446  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0899389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  21.71 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.62 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  30.15 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  28.23 
 
 		 277 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  24.06 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  22.86 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  21.97 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.79 
 
 		 779 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  26.58 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  23.53 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  31.76 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  22.14 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  21.17 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  23.26 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  23.02 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  21.71 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  23.48 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  30.59 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  26.56 
 
 		 529 aa  41.2  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  26.43 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  21.74 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  19.84 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 		 941 aa  40.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>