157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0587 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 		 349 aa  719    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  69.36 
 
 		 351 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  70.89 
 
 		 350 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  67.72 
 
 		 349 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  72.83 
 
 		 350 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  65.42 
 
 		 349 aa  471  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  69.65 
 
 		 350 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  65.42 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.83 
 
 		 349 aa  454  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  62.5 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  62.21 
 
 		 351 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.43 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  56.36 
 
 		 349 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  61.49 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.93 
 
 		 349 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  56.23 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.69 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  50.58 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.16 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  55.78 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  52.62 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  52.21 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  50.6 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  48.84 
 
 		 350 aa  358  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  50.43 
 
 		 350 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  49.12 
 
 		 352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  53.18 
 
 		 364 aa  355  6.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.12 
 
 		 343 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  48.7 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.59 
 
 		 350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.25 
 
 		 358 aa  342  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  48.56 
 
 		 359 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.7 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  47.43 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.87 
 
 		 350 aa  322  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  45.48 
 
 		 338 aa  319  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  46.08 
 
 		 345 aa  319  6e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  46.43 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  43.07 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  47.04 
 
 		 342 aa  295  9e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.04 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  42.12 
 
 		 344 aa  279  6e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.12 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.73 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.75 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  38.14 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  33.04 
 
 		 349 aa  209  8e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.32 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  34.13 
 
 		 347 aa  206  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  37.11 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  34.57 
 
 		 348 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.63 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.53 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.12 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.8 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  36 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  34.43 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  32.71 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  34.18 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  32.6 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  31.97 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  31.89 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.5 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0662  N-acetylneuraminate synthase  47.51 
 
 		 194 aa  186  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116223  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  34.27 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  30.06 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.04 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  32.74 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.04 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.9 
 
 		 354 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  31.23 
 
 		 342 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  32.53 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.48 
 
 		 350 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  33.53 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  32.74 
 
 		 748 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  31.71 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  31.68 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  34.68 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.31 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  36.76 
 
 		 672 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  30.72 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.81 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.96 
 
 		 749 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  32.87 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  33.64 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.9 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.7 
 
 		 334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.7 
 
 		 334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.74 
 
 		 749 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.74 
 
 		 749 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.08 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  35.66 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  32.58 
 
 		 359 aa  162  9e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.29 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.09 
 
 		 351 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.81 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  32.27 
 
 		 761 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.58 
 
 		 314 aa  156  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  30.24 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.75 
 
 		 762 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>